Protein–RNA interactions for Protein: Q3TSG4

Alkbh5, RNA demethylase ALKBH5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alkbh5Q3TSG4 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Alkbh5Q3TSG4 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Alkbh5Q3TSG4 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Alkbh5Q3TSG4 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Alkbh5Q3TSG4 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Alkbh5Q3TSG4 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Alkbh5Q3TSG4 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Alkbh5Q3TSG4 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Alkbh5Q3TSG4 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Alkbh5Q3TSG4 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Alkbh5Q3TSG4 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Alkbh5Q3TSG4 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Alkbh5Q3TSG4 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Alkbh5Q3TSG4 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Alkbh5Q3TSG4 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Alkbh5Q3TSG4 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Alkbh5Q3TSG4 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Alkbh5Q3TSG4 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Alkbh5Q3TSG4 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Alkbh5Q3TSG4 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Alkbh5Q3TSG4 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Alkbh5Q3TSG4 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Alkbh5Q3TSG4 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Alkbh5Q3TSG4 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Alkbh5Q3TSG4 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Alkbh5Q3TSG4 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Alkbh5Q3TSG4 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Alkbh5Q3TSG4 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Alkbh5Q3TSG4 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Alkbh5Q3TSG4 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Alkbh5Q3TSG4 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Alkbh5Q3TSG4 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Alkbh5Q3TSG4 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Alkbh5Q3TSG4 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Alkbh5Q3TSG4 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Alkbh5Q3TSG4 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Alkbh5Q3TSG4 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Alkbh5Q3TSG4 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Alkbh5Q3TSG4 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Alkbh5Q3TSG4 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Alkbh5Q3TSG4 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Alkbh5Q3TSG4 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Alkbh5Q3TSG4 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Alkbh5Q3TSG4 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Alkbh5Q3TSG4 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Alkbh5Q3TSG4 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Alkbh5Q3TSG4 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Alkbh5Q3TSG4 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Alkbh5Q3TSG4 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Alkbh5Q3TSG4 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Alkbh5Q3TSG4 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Alkbh5Q3TSG4 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Alkbh5Q3TSG4 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Alkbh5Q3TSG4 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Alkbh5Q3TSG4 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Alkbh5Q3TSG4 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Alkbh5Q3TSG4 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Alkbh5Q3TSG4 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Alkbh5Q3TSG4 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Alkbh5Q3TSG4 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Alkbh5Q3TSG4 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Alkbh5Q3TSG4 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Alkbh5Q3TSG4 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Alkbh5Q3TSG4 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Alkbh5Q3TSG4 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Alkbh5Q3TSG4 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Alkbh5Q3TSG4 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Alkbh5Q3TSG4 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Alkbh5Q3TSG4 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Alkbh5Q3TSG4 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Alkbh5Q3TSG4 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Alkbh5Q3TSG4 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Alkbh5Q3TSG4 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Alkbh5Q3TSG4 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Alkbh5Q3TSG4 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Alkbh5Q3TSG4 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Alkbh5Q3TSG4 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Alkbh5Q3TSG4 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Alkbh5Q3TSG4 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Alkbh5Q3TSG4 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Alkbh5Q3TSG4 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Alkbh5Q3TSG4 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Alkbh5Q3TSG4 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Alkbh5Q3TSG4 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Alkbh5Q3TSG4 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Alkbh5Q3TSG4 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Alkbh5Q3TSG4 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Alkbh5Q3TSG4 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Alkbh5Q3TSG4 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Alkbh5Q3TSG4 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Alkbh5Q3TSG4 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Alkbh5Q3TSG4 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Alkbh5Q3TSG4 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Alkbh5Q3TSG4 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Alkbh5Q3TSG4 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Alkbh5Q3TSG4 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Alkbh5Q3TSG4 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Alkbh5Q3TSG4 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Alkbh5Q3TSG4 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Alkbh5Q3TSG4 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.5 ms