Protein–RNA interactions for Protein: Q3TQS0

Calr4, Calreticulin 4, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calr4Q3TQS0 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Calr4Q3TQS0 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Calr4Q3TQS0 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Calr4Q3TQS0 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Calr4Q3TQS0 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Calr4Q3TQS0 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Calr4Q3TQS0 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Calr4Q3TQS0 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Calr4Q3TQS0 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Calr4Q3TQS0 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Calr4Q3TQS0 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Calr4Q3TQS0 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Calr4Q3TQS0 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Calr4Q3TQS0 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Calr4Q3TQS0 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Calr4Q3TQS0 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Calr4Q3TQS0 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Calr4Q3TQS0 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Calr4Q3TQS0 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Calr4Q3TQS0 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Calr4Q3TQS0 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Calr4Q3TQS0 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Calr4Q3TQS0 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Calr4Q3TQS0 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Calr4Q3TQS0 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Calr4Q3TQS0 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Calr4Q3TQS0 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Calr4Q3TQS0 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Calr4Q3TQS0 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Calr4Q3TQS0 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Calr4Q3TQS0 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Calr4Q3TQS0 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Calr4Q3TQS0 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Calr4Q3TQS0 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Calr4Q3TQS0 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Calr4Q3TQS0 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Calr4Q3TQS0 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Calr4Q3TQS0 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Calr4Q3TQS0 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Calr4Q3TQS0 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Calr4Q3TQS0 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Calr4Q3TQS0 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Calr4Q3TQS0 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Calr4Q3TQS0 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Calr4Q3TQS0 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Calr4Q3TQS0 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Calr4Q3TQS0 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Calr4Q3TQS0 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Calr4Q3TQS0 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Calr4Q3TQS0 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Calr4Q3TQS0 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Calr4Q3TQS0 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Calr4Q3TQS0 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Calr4Q3TQS0 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Calr4Q3TQS0 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Calr4Q3TQS0 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Calr4Q3TQS0 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Calr4Q3TQS0 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Calr4Q3TQS0 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Calr4Q3TQS0 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Calr4Q3TQS0 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Calr4Q3TQS0 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Calr4Q3TQS0 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Calr4Q3TQS0 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Calr4Q3TQS0 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Calr4Q3TQS0 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Calr4Q3TQS0 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Calr4Q3TQS0 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Calr4Q3TQS0 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Calr4Q3TQS0 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Calr4Q3TQS0 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Calr4Q3TQS0 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Calr4Q3TQS0 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Calr4Q3TQS0 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Calr4Q3TQS0 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Calr4Q3TQS0 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Calr4Q3TQS0 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Calr4Q3TQS0 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Calr4Q3TQS0 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Calr4Q3TQS0 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Calr4Q3TQS0 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Calr4Q3TQS0 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Calr4Q3TQS0 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Calr4Q3TQS0 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Calr4Q3TQS0 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Calr4Q3TQS0 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Calr4Q3TQS0 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Calr4Q3TQS0 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Calr4Q3TQS0 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Calr4Q3TQS0 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Calr4Q3TQS0 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Calr4Q3TQS0 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Calr4Q3TQS0 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Calr4Q3TQS0 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Calr4Q3TQS0 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Calr4Q3TQS0 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Calr4Q3TQS0 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Calr4Q3TQS0 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Calr4Q3TQS0 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Calr4Q3TQS0 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms