Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMP8

Tmem38a, Trimeric intracellular cation channel type A, mousemouse

Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem38aQ3TMP8 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem38aQ3TMP8 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem38aQ3TMP8 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem38aQ3TMP8 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem38aQ3TMP8 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem38aQ3TMP8 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem38aQ3TMP8 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem38aQ3TMP8 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem38aQ3TMP8 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem38aQ3TMP8 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem38aQ3TMP8 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem38aQ3TMP8 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem38aQ3TMP8 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem38aQ3TMP8 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem38aQ3TMP8 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem38aQ3TMP8 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem38aQ3TMP8 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem38aQ3TMP8 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem38aQ3TMP8 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem38aQ3TMP8 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem38aQ3TMP8 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem38aQ3TMP8 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem38aQ3TMP8 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem38aQ3TMP8 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem38aQ3TMP8 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem38aQ3TMP8 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem38aQ3TMP8 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem38aQ3TMP8 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem38aQ3TMP8 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem38aQ3TMP8 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem38aQ3TMP8 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem38aQ3TMP8 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem38aQ3TMP8 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem38aQ3TMP8 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem38aQ3TMP8 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem38aQ3TMP8 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem38aQ3TMP8 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem38aQ3TMP8 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem38aQ3TMP8 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem38aQ3TMP8 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem38aQ3TMP8 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem38aQ3TMP8 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem38aQ3TMP8 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem38aQ3TMP8 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem38aQ3TMP8 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem38aQ3TMP8 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem38aQ3TMP8 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem38aQ3TMP8 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem38aQ3TMP8 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem38aQ3TMP8 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem38aQ3TMP8 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem38aQ3TMP8 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem38aQ3TMP8 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem38aQ3TMP8 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem38aQ3TMP8 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem38aQ3TMP8 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem38aQ3TMP8 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem38aQ3TMP8 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem38aQ3TMP8 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem38aQ3TMP8 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem38aQ3TMP8 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem38aQ3TMP8 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem38aQ3TMP8 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem38aQ3TMP8 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem38aQ3TMP8 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmem38aQ3TMP8 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmem38aQ3TMP8 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmem38aQ3TMP8 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmem38aQ3TMP8 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmem38aQ3TMP8 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmem38aQ3TMP8 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmem38aQ3TMP8 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmem38aQ3TMP8 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmem38aQ3TMP8 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmem38aQ3TMP8 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmem38aQ3TMP8 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmem38aQ3TMP8 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmem38aQ3TMP8 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmem38aQ3TMP8 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmem38aQ3TMP8 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmem38aQ3TMP8 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmem38aQ3TMP8 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmem38aQ3TMP8 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmem38aQ3TMP8 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmem38aQ3TMP8 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmem38aQ3TMP8 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmem38aQ3TMP8 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem38aQ3TMP8 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem38aQ3TMP8 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem38aQ3TMP8 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem38aQ3TMP8 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem38aQ3TMP8 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem38aQ3TMP8 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem38aQ3TMP8 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem38aQ3TMP8 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem38aQ3TMP8 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem38aQ3TMP8 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem38aQ3TMP8 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem38aQ3TMP8 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem38aQ3TMP8 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms