Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMP1

Gtf3c3, General transcription factor IIIC, polypeptide 3, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c3Q3TMP1 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gtf3c3Q3TMP1 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gtf3c3Q3TMP1 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gtf3c3Q3TMP1 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gtf3c3Q3TMP1 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gtf3c3Q3TMP1 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gtf3c3Q3TMP1 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gtf3c3Q3TMP1 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gtf3c3Q3TMP1 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gtf3c3Q3TMP1 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gtf3c3Q3TMP1 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gtf3c3Q3TMP1 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gtf3c3Q3TMP1 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gtf3c3Q3TMP1 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gtf3c3Q3TMP1 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gtf3c3Q3TMP1 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gtf3c3Q3TMP1 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Gtf3c3Q3TMP1 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gtf3c3Q3TMP1 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gtf3c3Q3TMP1 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gtf3c3Q3TMP1 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gtf3c3Q3TMP1 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gtf3c3Q3TMP1 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gtf3c3Q3TMP1 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gtf3c3Q3TMP1 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gtf3c3Q3TMP1 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gtf3c3Q3TMP1 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gtf3c3Q3TMP1 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gtf3c3Q3TMP1 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gtf3c3Q3TMP1 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gtf3c3Q3TMP1 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gtf3c3Q3TMP1 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gtf3c3Q3TMP1 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gtf3c3Q3TMP1 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gtf3c3Q3TMP1 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gtf3c3Q3TMP1 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gtf3c3Q3TMP1 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gtf3c3Q3TMP1 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gtf3c3Q3TMP1 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gtf3c3Q3TMP1 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gtf3c3Q3TMP1 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gtf3c3Q3TMP1 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gtf3c3Q3TMP1 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gtf3c3Q3TMP1 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Gtf3c3Q3TMP1 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gtf3c3Q3TMP1 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gtf3c3Q3TMP1 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gtf3c3Q3TMP1 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gtf3c3Q3TMP1 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gtf3c3Q3TMP1 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gtf3c3Q3TMP1 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gtf3c3Q3TMP1 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gtf3c3Q3TMP1 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gtf3c3Q3TMP1 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Gtf3c3Q3TMP1 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gtf3c3Q3TMP1 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gtf3c3Q3TMP1 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gtf3c3Q3TMP1 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gtf3c3Q3TMP1 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gtf3c3Q3TMP1 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gtf3c3Q3TMP1 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gtf3c3Q3TMP1 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gtf3c3Q3TMP1 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gtf3c3Q3TMP1 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gtf3c3Q3TMP1 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gtf3c3Q3TMP1 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gtf3c3Q3TMP1 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gtf3c3Q3TMP1 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gtf3c3Q3TMP1 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gtf3c3Q3TMP1 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gtf3c3Q3TMP1 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gtf3c3Q3TMP1 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gtf3c3Q3TMP1 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gtf3c3Q3TMP1 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gtf3c3Q3TMP1 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gtf3c3Q3TMP1 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gtf3c3Q3TMP1 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gtf3c3Q3TMP1 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gtf3c3Q3TMP1 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gtf3c3Q3TMP1 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gtf3c3Q3TMP1 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gtf3c3Q3TMP1 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gtf3c3Q3TMP1 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gtf3c3Q3TMP1 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gtf3c3Q3TMP1 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Gtf3c3Q3TMP1 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gtf3c3Q3TMP1 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Gtf3c3Q3TMP1 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Gtf3c3Q3TMP1 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gtf3c3Q3TMP1 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gtf3c3Q3TMP1 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gtf3c3Q3TMP1 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gtf3c3Q3TMP1 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gtf3c3Q3TMP1 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gtf3c3Q3TMP1 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gtf3c3Q3TMP1 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gtf3c3Q3TMP1 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gtf3c3Q3TMP1 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gtf3c3Q3TMP1 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gtf3c3Q3TMP1 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms