Protein–RNA interactions for Protein: Q3TKT4

Smarca4, Transcription activator BRG1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca4Q3TKT4 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Smarca4Q3TKT4 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Smarca4Q3TKT4 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Smarca4Q3TKT4 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
Smarca4Q3TKT4 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Smarca4Q3TKT4 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Smarca4Q3TKT4 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Smarca4Q3TKT4 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Smarca4Q3TKT4 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Smarca4Q3TKT4 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Smarca4Q3TKT4 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
Smarca4Q3TKT4 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Smarca4Q3TKT4 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Smarca4Q3TKT4 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Smarca4Q3TKT4 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Smarca4Q3TKT4 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
Smarca4Q3TKT4 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Smarca4Q3TKT4 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Smarca4Q3TKT4 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Smarca4Q3TKT4 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Smarca4Q3TKT4 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Smarca4Q3TKT4 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Smarca4Q3TKT4 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Smarca4Q3TKT4 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Smarca4Q3TKT4 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Smarca4Q3TKT4 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Smarca4Q3TKT4 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Smarca4Q3TKT4 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Smarca4Q3TKT4 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Smarca4Q3TKT4 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Smarca4Q3TKT4 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Smarca4Q3TKT4 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Smarca4Q3TKT4 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Smarca4Q3TKT4 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Smarca4Q3TKT4 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Smarca4Q3TKT4 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
Smarca4Q3TKT4 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Smarca4Q3TKT4 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Smarca4Q3TKT4 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Smarca4Q3TKT4 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Smarca4Q3TKT4 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Smarca4Q3TKT4 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Smarca4Q3TKT4 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Smarca4Q3TKT4 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Smarca4Q3TKT4 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Smarca4Q3TKT4 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Smarca4Q3TKT4 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Smarca4Q3TKT4 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
Smarca4Q3TKT4 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
Smarca4Q3TKT4 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Smarca4Q3TKT4 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Smarca4Q3TKT4 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Smarca4Q3TKT4 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
Smarca4Q3TKT4 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Smarca4Q3TKT4 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Smarca4Q3TKT4 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
Smarca4Q3TKT4 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Smarca4Q3TKT4 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Smarca4Q3TKT4 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Smarca4Q3TKT4 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Smarca4Q3TKT4 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
Smarca4Q3TKT4 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Smarca4Q3TKT4 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Smarca4Q3TKT4 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Smarca4Q3TKT4 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Smarca4Q3TKT4 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Smarca4Q3TKT4 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Smarca4Q3TKT4 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Smarca4Q3TKT4 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Smarca4Q3TKT4 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Smarca4Q3TKT4 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Smarca4Q3TKT4 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
Smarca4Q3TKT4 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Smarca4Q3TKT4 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Smarca4Q3TKT4 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Smarca4Q3TKT4 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Smarca4Q3TKT4 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
Smarca4Q3TKT4 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC29■■■□□ 2.23
Smarca4Q3TKT4 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC29■■■□□ 2.23
Smarca4Q3TKT4 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Smarca4Q3TKT4 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Smarca4Q3TKT4 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Smarca4Q3TKT4 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Smarca4Q3TKT4 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Smarca4Q3TKT4 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
Smarca4Q3TKT4 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Smarca4Q3TKT4 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Smarca4Q3TKT4 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
Smarca4Q3TKT4 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Smarca4Q3TKT4 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
Smarca4Q3TKT4 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Smarca4Q3TKT4 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Smarca4Q3TKT4 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Smarca4Q3TKT4 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Smarca4Q3TKT4 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Smarca4Q3TKT4 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
Smarca4Q3TKT4 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
Smarca4Q3TKT4 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Smarca4Q3TKT4 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Smarca4Q3TKT4 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms