Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIR1

Trappc13, Trafficking protein particle complex subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc13Q3TIR1 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trappc13Q3TIR1 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trappc13Q3TIR1 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trappc13Q3TIR1 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trappc13Q3TIR1 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trappc13Q3TIR1 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trappc13Q3TIR1 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trappc13Q3TIR1 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trappc13Q3TIR1 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trappc13Q3TIR1 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trappc13Q3TIR1 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trappc13Q3TIR1 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trappc13Q3TIR1 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trappc13Q3TIR1 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trappc13Q3TIR1 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trappc13Q3TIR1 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trappc13Q3TIR1 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trappc13Q3TIR1 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trappc13Q3TIR1 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trappc13Q3TIR1 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trappc13Q3TIR1 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trappc13Q3TIR1 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Trappc13Q3TIR1 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trappc13Q3TIR1 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trappc13Q3TIR1 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trappc13Q3TIR1 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Trappc13Q3TIR1 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trappc13Q3TIR1 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trappc13Q3TIR1 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trappc13Q3TIR1 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trappc13Q3TIR1 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Trappc13Q3TIR1 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trappc13Q3TIR1 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trappc13Q3TIR1 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trappc13Q3TIR1 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trappc13Q3TIR1 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trappc13Q3TIR1 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trappc13Q3TIR1 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trappc13Q3TIR1 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Trappc13Q3TIR1 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trappc13Q3TIR1 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trappc13Q3TIR1 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trappc13Q3TIR1 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trappc13Q3TIR1 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trappc13Q3TIR1 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trappc13Q3TIR1 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trappc13Q3TIR1 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Trappc13Q3TIR1 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trappc13Q3TIR1 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trappc13Q3TIR1 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trappc13Q3TIR1 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trappc13Q3TIR1 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trappc13Q3TIR1 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trappc13Q3TIR1 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trappc13Q3TIR1 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Trappc13Q3TIR1 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trappc13Q3TIR1 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trappc13Q3TIR1 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trappc13Q3TIR1 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trappc13Q3TIR1 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trappc13Q3TIR1 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trappc13Q3TIR1 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trappc13Q3TIR1 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trappc13Q3TIR1 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trappc13Q3TIR1 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trappc13Q3TIR1 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trappc13Q3TIR1 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trappc13Q3TIR1 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Trappc13Q3TIR1 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trappc13Q3TIR1 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Trappc13Q3TIR1 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trappc13Q3TIR1 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trappc13Q3TIR1 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trappc13Q3TIR1 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trappc13Q3TIR1 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trappc13Q3TIR1 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trappc13Q3TIR1 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trappc13Q3TIR1 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trappc13Q3TIR1 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trappc13Q3TIR1 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trappc13Q3TIR1 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trappc13Q3TIR1 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trappc13Q3TIR1 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trappc13Q3TIR1 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trappc13Q3TIR1 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trappc13Q3TIR1 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trappc13Q3TIR1 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trappc13Q3TIR1 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trappc13Q3TIR1 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trappc13Q3TIR1 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trappc13Q3TIR1 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trappc13Q3TIR1 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trappc13Q3TIR1 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Trappc13Q3TIR1 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Trappc13Q3TIR1 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trappc13Q3TIR1 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trappc13Q3TIR1 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trappc13Q3TIR1 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trappc13Q3TIR1 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Trappc13Q3TIR1 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms