Protein–RNA interactions for Protein: Q3MI99

Ccbe1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccbe1Q3MI99 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccbe1Q3MI99 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccbe1Q3MI99 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccbe1Q3MI99 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccbe1Q3MI99 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccbe1Q3MI99 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccbe1Q3MI99 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccbe1Q3MI99 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccbe1Q3MI99 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccbe1Q3MI99 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccbe1Q3MI99 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccbe1Q3MI99 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccbe1Q3MI99 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccbe1Q3MI99 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccbe1Q3MI99 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccbe1Q3MI99 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccbe1Q3MI99 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccbe1Q3MI99 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccbe1Q3MI99 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccbe1Q3MI99 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccbe1Q3MI99 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccbe1Q3MI99 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccbe1Q3MI99 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccbe1Q3MI99 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccbe1Q3MI99 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccbe1Q3MI99 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccbe1Q3MI99 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccbe1Q3MI99 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccbe1Q3MI99 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccbe1Q3MI99 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccbe1Q3MI99 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccbe1Q3MI99 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccbe1Q3MI99 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccbe1Q3MI99 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccbe1Q3MI99 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccbe1Q3MI99 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccbe1Q3MI99 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccbe1Q3MI99 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccbe1Q3MI99 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccbe1Q3MI99 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccbe1Q3MI99 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccbe1Q3MI99 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccbe1Q3MI99 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccbe1Q3MI99 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccbe1Q3MI99 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccbe1Q3MI99 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccbe1Q3MI99 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccbe1Q3MI99 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccbe1Q3MI99 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccbe1Q3MI99 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccbe1Q3MI99 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccbe1Q3MI99 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccbe1Q3MI99 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccbe1Q3MI99 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccbe1Q3MI99 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccbe1Q3MI99 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccbe1Q3MI99 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccbe1Q3MI99 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccbe1Q3MI99 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccbe1Q3MI99 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccbe1Q3MI99 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccbe1Q3MI99 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccbe1Q3MI99 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccbe1Q3MI99 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccbe1Q3MI99 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccbe1Q3MI99 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccbe1Q3MI99 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccbe1Q3MI99 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccbe1Q3MI99 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccbe1Q3MI99 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccbe1Q3MI99 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccbe1Q3MI99 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccbe1Q3MI99 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccbe1Q3MI99 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccbe1Q3MI99 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccbe1Q3MI99 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccbe1Q3MI99 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccbe1Q3MI99 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccbe1Q3MI99 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccbe1Q3MI99 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccbe1Q3MI99 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccbe1Q3MI99 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccbe1Q3MI99 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccbe1Q3MI99 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccbe1Q3MI99 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccbe1Q3MI99 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccbe1Q3MI99 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccbe1Q3MI99 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccbe1Q3MI99 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccbe1Q3MI99 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccbe1Q3MI99 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccbe1Q3MI99 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccbe1Q3MI99 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccbe1Q3MI99 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccbe1Q3MI99 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccbe1Q3MI99 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccbe1Q3MI99 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccbe1Q3MI99 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccbe1Q3MI99 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccbe1Q3MI99 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms