Protein–RNA interactions for Protein: Q33DR3

Pdss2, Decaprenyl-diphosphate synthase subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 401 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdss2Q33DR3 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdss2Q33DR3 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdss2Q33DR3 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdss2Q33DR3 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdss2Q33DR3 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdss2Q33DR3 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdss2Q33DR3 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdss2Q33DR3 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdss2Q33DR3 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdss2Q33DR3 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdss2Q33DR3 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdss2Q33DR3 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdss2Q33DR3 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdss2Q33DR3 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdss2Q33DR3 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdss2Q33DR3 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdss2Q33DR3 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdss2Q33DR3 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdss2Q33DR3 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdss2Q33DR3 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdss2Q33DR3 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdss2Q33DR3 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdss2Q33DR3 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdss2Q33DR3 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdss2Q33DR3 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdss2Q33DR3 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdss2Q33DR3 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdss2Q33DR3 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdss2Q33DR3 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdss2Q33DR3 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdss2Q33DR3 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdss2Q33DR3 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdss2Q33DR3 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdss2Q33DR3 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdss2Q33DR3 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdss2Q33DR3 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdss2Q33DR3 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdss2Q33DR3 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdss2Q33DR3 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdss2Q33DR3 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdss2Q33DR3 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdss2Q33DR3 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdss2Q33DR3 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdss2Q33DR3 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdss2Q33DR3 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdss2Q33DR3 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdss2Q33DR3 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdss2Q33DR3 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdss2Q33DR3 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdss2Q33DR3 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdss2Q33DR3 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdss2Q33DR3 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdss2Q33DR3 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Pdss2Q33DR3 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pdss2Q33DR3 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pdss2Q33DR3 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pdss2Q33DR3 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pdss2Q33DR3 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pdss2Q33DR3 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pdss2Q33DR3 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pdss2Q33DR3 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pdss2Q33DR3 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Pdss2Q33DR3 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pdss2Q33DR3 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pdss2Q33DR3 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pdss2Q33DR3 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pdss2Q33DR3 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pdss2Q33DR3 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pdss2Q33DR3 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pdss2Q33DR3 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pdss2Q33DR3 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pdss2Q33DR3 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pdss2Q33DR3 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pdss2Q33DR3 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdss2Q33DR3 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdss2Q33DR3 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdss2Q33DR3 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdss2Q33DR3 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdss2Q33DR3 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdss2Q33DR3 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdss2Q33DR3 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdss2Q33DR3 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdss2Q33DR3 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdss2Q33DR3 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdss2Q33DR3 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdss2Q33DR3 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdss2Q33DR3 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdss2Q33DR3 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdss2Q33DR3 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdss2Q33DR3 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdss2Q33DR3 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdss2Q33DR3 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pdss2Q33DR3 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdss2Q33DR3 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdss2Q33DR3 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdss2Q33DR3 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdss2Q33DR3 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdss2Q33DR3 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdss2Q33DR3 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdss2Q33DR3 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms