Protein–RNA interactions for Protein: Q30KN3

Defb33, Beta-defensin 33, mousemouse

Predictions only

Length 62 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defb33Q30KN3 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Defb33Q30KN3 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Defb33Q30KN3 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Defb33Q30KN3 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Defb33Q30KN3 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Defb33Q30KN3 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Defb33Q30KN3 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Defb33Q30KN3 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Defb33Q30KN3 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Defb33Q30KN3 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Defb33Q30KN3 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Defb33Q30KN3 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Defb33Q30KN3 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Defb33Q30KN3 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Defb33Q30KN3 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Defb33Q30KN3 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC14.65□□□□□ -0.07
Defb33Q30KN3 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Defb33Q30KN3 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Defb33Q30KN3 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Defb33Q30KN3 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Defb33Q30KN3 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Defb33Q30KN3 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Defb33Q30KN3 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Defb33Q30KN3 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Defb33Q30KN3 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Defb33Q30KN3 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Defb33Q30KN3 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Defb33Q30KN3 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Defb33Q30KN3 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Defb33Q30KN3 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Defb33Q30KN3 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Defb33Q30KN3 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Defb33Q30KN3 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Defb33Q30KN3 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Defb33Q30KN3 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Defb33Q30KN3 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Defb33Q30KN3 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Defb33Q30KN3 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Defb33Q30KN3 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Defb33Q30KN3 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Defb33Q30KN3 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Defb33Q30KN3 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Defb33Q30KN3 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Defb33Q30KN3 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Defb33Q30KN3 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Defb33Q30KN3 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Defb33Q30KN3 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Defb33Q30KN3 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Defb33Q30KN3 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Defb33Q30KN3 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Defb33Q30KN3 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Defb33Q30KN3 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Defb33Q30KN3 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Defb33Q30KN3 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Defb33Q30KN3 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Defb33Q30KN3 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Defb33Q30KN3 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Defb33Q30KN3 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Defb33Q30KN3 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Defb33Q30KN3 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Defb33Q30KN3 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Defb33Q30KN3 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Defb33Q30KN3 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Defb33Q30KN3 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Defb33Q30KN3 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Defb33Q30KN3 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Defb33Q30KN3 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Defb33Q30KN3 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Defb33Q30KN3 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Defb33Q30KN3 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Defb33Q30KN3 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Defb33Q30KN3 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Defb33Q30KN3 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Defb33Q30KN3 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Defb33Q30KN3 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Defb33Q30KN3 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Defb33Q30KN3 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Defb33Q30KN3 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Defb33Q30KN3 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Defb33Q30KN3 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Defb33Q30KN3 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Defb33Q30KN3 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Defb33Q30KN3 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Defb33Q30KN3 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Defb33Q30KN3 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Defb33Q30KN3 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Defb33Q30KN3 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Defb33Q30KN3 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Defb33Q30KN3 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Defb33Q30KN3 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Defb33Q30KN3 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Defb33Q30KN3 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Defb33Q30KN3 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Defb33Q30KN3 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Defb33Q30KN3 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Defb33Q30KN3 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Defb33Q30KN3 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Defb33Q30KN3 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Defb33Q30KN3 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Defb33Q30KN3 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms