Protein–RNA interactions for Protein: Q307W7

Kncn, Kinocilin, mousemouse

Predictions only

Length 124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KncnQ307W7 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
KncnQ307W7 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
KncnQ307W7 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
KncnQ307W7 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
KncnQ307W7 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
KncnQ307W7 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
KncnQ307W7 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
KncnQ307W7 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
KncnQ307W7 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
KncnQ307W7 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
KncnQ307W7 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
KncnQ307W7 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
KncnQ307W7 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
KncnQ307W7 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
KncnQ307W7 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
KncnQ307W7 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
KncnQ307W7 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
KncnQ307W7 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
KncnQ307W7 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
KncnQ307W7 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
KncnQ307W7 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
KncnQ307W7 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
KncnQ307W7 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
KncnQ307W7 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
KncnQ307W7 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
KncnQ307W7 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
KncnQ307W7 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
KncnQ307W7 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
KncnQ307W7 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
KncnQ307W7 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
KncnQ307W7 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
KncnQ307W7 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
KncnQ307W7 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
KncnQ307W7 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
KncnQ307W7 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
KncnQ307W7 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
KncnQ307W7 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
KncnQ307W7 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
KncnQ307W7 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
KncnQ307W7 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
KncnQ307W7 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
KncnQ307W7 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
KncnQ307W7 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
KncnQ307W7 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
KncnQ307W7 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
KncnQ307W7 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
KncnQ307W7 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
KncnQ307W7 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
KncnQ307W7 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
KncnQ307W7 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
KncnQ307W7 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
KncnQ307W7 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
KncnQ307W7 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
KncnQ307W7 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
KncnQ307W7 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
KncnQ307W7 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
KncnQ307W7 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
KncnQ307W7 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
KncnQ307W7 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
KncnQ307W7 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
KncnQ307W7 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
KncnQ307W7 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
KncnQ307W7 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
KncnQ307W7 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
KncnQ307W7 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
KncnQ307W7 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
KncnQ307W7 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
KncnQ307W7 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.23
KncnQ307W7 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KncnQ307W7 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KncnQ307W7 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KncnQ307W7 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KncnQ307W7 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KncnQ307W7 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KncnQ307W7 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KncnQ307W7 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KncnQ307W7 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KncnQ307W7 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KncnQ307W7 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KncnQ307W7 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KncnQ307W7 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KncnQ307W7 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KncnQ307W7 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
KncnQ307W7 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KncnQ307W7 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KncnQ307W7 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
KncnQ307W7 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
KncnQ307W7 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KncnQ307W7 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
KncnQ307W7 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KncnQ307W7 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
KncnQ307W7 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KncnQ307W7 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KncnQ307W7 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KncnQ307W7 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KncnQ307W7 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KncnQ307W7 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
KncnQ307W7 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KncnQ307W7 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KncnQ307W7 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms