Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKI2

Vax1, Ventral anterior homeobox 1, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vax1Q2NKI2 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vax1Q2NKI2 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vax1Q2NKI2 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vax1Q2NKI2 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vax1Q2NKI2 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vax1Q2NKI2 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vax1Q2NKI2 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vax1Q2NKI2 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vax1Q2NKI2 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Vax1Q2NKI2 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vax1Q2NKI2 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Vax1Q2NKI2 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vax1Q2NKI2 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vax1Q2NKI2 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vax1Q2NKI2 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vax1Q2NKI2 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vax1Q2NKI2 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vax1Q2NKI2 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Vax1Q2NKI2 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vax1Q2NKI2 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vax1Q2NKI2 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vax1Q2NKI2 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vax1Q2NKI2 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vax1Q2NKI2 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vax1Q2NKI2 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vax1Q2NKI2 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vax1Q2NKI2 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vax1Q2NKI2 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vax1Q2NKI2 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vax1Q2NKI2 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vax1Q2NKI2 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vax1Q2NKI2 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Vax1Q2NKI2 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vax1Q2NKI2 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vax1Q2NKI2 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vax1Q2NKI2 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vax1Q2NKI2 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vax1Q2NKI2 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vax1Q2NKI2 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vax1Q2NKI2 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vax1Q2NKI2 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vax1Q2NKI2 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vax1Q2NKI2 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vax1Q2NKI2 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vax1Q2NKI2 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vax1Q2NKI2 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vax1Q2NKI2 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vax1Q2NKI2 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vax1Q2NKI2 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vax1Q2NKI2 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vax1Q2NKI2 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vax1Q2NKI2 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vax1Q2NKI2 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vax1Q2NKI2 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vax1Q2NKI2 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vax1Q2NKI2 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vax1Q2NKI2 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vax1Q2NKI2 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vax1Q2NKI2 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vax1Q2NKI2 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vax1Q2NKI2 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Vax1Q2NKI2 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vax1Q2NKI2 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vax1Q2NKI2 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vax1Q2NKI2 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vax1Q2NKI2 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vax1Q2NKI2 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vax1Q2NKI2 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Vax1Q2NKI2 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vax1Q2NKI2 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vax1Q2NKI2 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Vax1Q2NKI2 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Vax1Q2NKI2 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vax1Q2NKI2 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vax1Q2NKI2 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vax1Q2NKI2 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vax1Q2NKI2 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vax1Q2NKI2 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vax1Q2NKI2 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vax1Q2NKI2 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vax1Q2NKI2 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vax1Q2NKI2 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vax1Q2NKI2 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vax1Q2NKI2 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Vax1Q2NKI2 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vax1Q2NKI2 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vax1Q2NKI2 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Vax1Q2NKI2 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Vax1Q2NKI2 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Vax1Q2NKI2 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Vax1Q2NKI2 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Vax1Q2NKI2 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vax1Q2NKI2 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vax1Q2NKI2 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vax1Q2NKI2 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vax1Q2NKI2 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Vax1Q2NKI2 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Vax1Q2NKI2 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Vax1Q2NKI2 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Vax1Q2NKI2 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms