Protein–RNA interactions for Protein: Q2EG98

Pkd1l3, Polycystic kidney disease protein 1-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 2,201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd1l3Q2EG98 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pkd1l3Q2EG98 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pkd1l3Q2EG98 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pkd1l3Q2EG98 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pkd1l3Q2EG98 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pkd1l3Q2EG98 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pkd1l3Q2EG98 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pkd1l3Q2EG98 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pkd1l3Q2EG98 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pkd1l3Q2EG98 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Pkd1l3Q2EG98 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pkd1l3Q2EG98 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pkd1l3Q2EG98 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pkd1l3Q2EG98 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pkd1l3Q2EG98 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pkd1l3Q2EG98 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pkd1l3Q2EG98 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pkd1l3Q2EG98 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pkd1l3Q2EG98 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pkd1l3Q2EG98 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pkd1l3Q2EG98 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pkd1l3Q2EG98 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pkd1l3Q2EG98 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pkd1l3Q2EG98 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pkd1l3Q2EG98 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pkd1l3Q2EG98 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pkd1l3Q2EG98 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pkd1l3Q2EG98 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pkd1l3Q2EG98 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pkd1l3Q2EG98 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pkd1l3Q2EG98 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Pkd1l3Q2EG98 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pkd1l3Q2EG98 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pkd1l3Q2EG98 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Pkd1l3Q2EG98 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pkd1l3Q2EG98 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pkd1l3Q2EG98 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pkd1l3Q2EG98 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pkd1l3Q2EG98 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pkd1l3Q2EG98 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pkd1l3Q2EG98 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pkd1l3Q2EG98 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pkd1l3Q2EG98 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Pkd1l3Q2EG98 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pkd1l3Q2EG98 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pkd1l3Q2EG98 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pkd1l3Q2EG98 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pkd1l3Q2EG98 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pkd1l3Q2EG98 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pkd1l3Q2EG98 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pkd1l3Q2EG98 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pkd1l3Q2EG98 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pkd1l3Q2EG98 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pkd1l3Q2EG98 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pkd1l3Q2EG98 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pkd1l3Q2EG98 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Pkd1l3Q2EG98 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pkd1l3Q2EG98 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pkd1l3Q2EG98 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Pkd1l3Q2EG98 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pkd1l3Q2EG98 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pkd1l3Q2EG98 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pkd1l3Q2EG98 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pkd1l3Q2EG98 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pkd1l3Q2EG98 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pkd1l3Q2EG98 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pkd1l3Q2EG98 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pkd1l3Q2EG98 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Pkd1l3Q2EG98 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pkd1l3Q2EG98 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pkd1l3Q2EG98 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Pkd1l3Q2EG98 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pkd1l3Q2EG98 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pkd1l3Q2EG98 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pkd1l3Q2EG98 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pkd1l3Q2EG98 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pkd1l3Q2EG98 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pkd1l3Q2EG98 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pkd1l3Q2EG98 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pkd1l3Q2EG98 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pkd1l3Q2EG98 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pkd1l3Q2EG98 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pkd1l3Q2EG98 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pkd1l3Q2EG98 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pkd1l3Q2EG98 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pkd1l3Q2EG98 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pkd1l3Q2EG98 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pkd1l3Q2EG98 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pkd1l3Q2EG98 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pkd1l3Q2EG98 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pkd1l3Q2EG98 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pkd1l3Q2EG98 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Pkd1l3Q2EG98 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Pkd1l3Q2EG98 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Pkd1l3Q2EG98 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pkd1l3Q2EG98 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
Pkd1l3Q2EG98 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pkd1l3Q2EG98 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pkd1l3Q2EG98 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pkd1l3Q2EG98 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms