Protein–RNA interactions for Protein: Q1A3B0

Cers3, Ceramide synthase 3, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cers3Q1A3B0 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cers3Q1A3B0 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cers3Q1A3B0 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Cers3Q1A3B0 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cers3Q1A3B0 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cers3Q1A3B0 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cers3Q1A3B0 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cers3Q1A3B0 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cers3Q1A3B0 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cers3Q1A3B0 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cers3Q1A3B0 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cers3Q1A3B0 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Cers3Q1A3B0 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cers3Q1A3B0 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Cers3Q1A3B0 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cers3Q1A3B0 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Cers3Q1A3B0 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Cers3Q1A3B0 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cers3Q1A3B0 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cers3Q1A3B0 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cers3Q1A3B0 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Cers3Q1A3B0 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cers3Q1A3B0 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cers3Q1A3B0 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cers3Q1A3B0 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cers3Q1A3B0 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cers3Q1A3B0 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cers3Q1A3B0 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cers3Q1A3B0 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cers3Q1A3B0 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cers3Q1A3B0 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cers3Q1A3B0 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cers3Q1A3B0 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Cers3Q1A3B0 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cers3Q1A3B0 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cers3Q1A3B0 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cers3Q1A3B0 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cers3Q1A3B0 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cers3Q1A3B0 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cers3Q1A3B0 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Cers3Q1A3B0 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cers3Q1A3B0 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cers3Q1A3B0 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cers3Q1A3B0 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cers3Q1A3B0 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cers3Q1A3B0 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cers3Q1A3B0 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cers3Q1A3B0 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cers3Q1A3B0 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cers3Q1A3B0 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cers3Q1A3B0 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Cers3Q1A3B0 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Cers3Q1A3B0 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cers3Q1A3B0 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cers3Q1A3B0 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cers3Q1A3B0 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cers3Q1A3B0 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cers3Q1A3B0 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cers3Q1A3B0 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cers3Q1A3B0 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cers3Q1A3B0 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cers3Q1A3B0 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cers3Q1A3B0 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cers3Q1A3B0 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cers3Q1A3B0 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cers3Q1A3B0 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cers3Q1A3B0 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cers3Q1A3B0 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cers3Q1A3B0 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cers3Q1A3B0 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Cers3Q1A3B0 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cers3Q1A3B0 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Cers3Q1A3B0 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cers3Q1A3B0 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cers3Q1A3B0 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cers3Q1A3B0 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cers3Q1A3B0 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cers3Q1A3B0 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cers3Q1A3B0 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cers3Q1A3B0 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cers3Q1A3B0 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cers3Q1A3B0 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cers3Q1A3B0 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cers3Q1A3B0 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Cers3Q1A3B0 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cers3Q1A3B0 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cers3Q1A3B0 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cers3Q1A3B0 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cers3Q1A3B0 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cers3Q1A3B0 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cers3Q1A3B0 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cers3Q1A3B0 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cers3Q1A3B0 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cers3Q1A3B0 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cers3Q1A3B0 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cers3Q1A3B0 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cers3Q1A3B0 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cers3Q1A3B0 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cers3Q1A3B0 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cers3Q1A3B0 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms