Protein–RNA interactions for Protein: Q14CH0

Fam171b, Protein FAM171B, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam171bQ14CH0 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Fam171bQ14CH0 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Fam171bQ14CH0 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Fam171bQ14CH0 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Fam171bQ14CH0 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Fam171bQ14CH0 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Fam171bQ14CH0 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Fam171bQ14CH0 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Fam171bQ14CH0 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Fam171bQ14CH0 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Fam171bQ14CH0 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Fam171bQ14CH0 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Fam171bQ14CH0 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Fam171bQ14CH0 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Fam171bQ14CH0 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Fam171bQ14CH0 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Fam171bQ14CH0 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Fam171bQ14CH0 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Fam171bQ14CH0 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Fam171bQ14CH0 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Fam171bQ14CH0 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Fam171bQ14CH0 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Fam171bQ14CH0 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Fam171bQ14CH0 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Fam171bQ14CH0 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Fam171bQ14CH0 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Fam171bQ14CH0 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Fam171bQ14CH0 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Fam171bQ14CH0 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Fam171bQ14CH0 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Fam171bQ14CH0 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Fam171bQ14CH0 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Fam171bQ14CH0 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Fam171bQ14CH0 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Fam171bQ14CH0 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Fam171bQ14CH0 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Fam171bQ14CH0 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Fam171bQ14CH0 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Fam171bQ14CH0 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fam171bQ14CH0 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fam171bQ14CH0 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Fam171bQ14CH0 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fam171bQ14CH0 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fam171bQ14CH0 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fam171bQ14CH0 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fam171bQ14CH0 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fam171bQ14CH0 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fam171bQ14CH0 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fam171bQ14CH0 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fam171bQ14CH0 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Fam171bQ14CH0 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fam171bQ14CH0 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fam171bQ14CH0 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fam171bQ14CH0 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fam171bQ14CH0 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fam171bQ14CH0 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fam171bQ14CH0 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fam171bQ14CH0 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fam171bQ14CH0 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fam171bQ14CH0 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fam171bQ14CH0 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Fam171bQ14CH0 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fam171bQ14CH0 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fam171bQ14CH0 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fam171bQ14CH0 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fam171bQ14CH0 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fam171bQ14CH0 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fam171bQ14CH0 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fam171bQ14CH0 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fam171bQ14CH0 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fam171bQ14CH0 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fam171bQ14CH0 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fam171bQ14CH0 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fam171bQ14CH0 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fam171bQ14CH0 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fam171bQ14CH0 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fam171bQ14CH0 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fam171bQ14CH0 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fam171bQ14CH0 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fam171bQ14CH0 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fam171bQ14CH0 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fam171bQ14CH0 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fam171bQ14CH0 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fam171bQ14CH0 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fam171bQ14CH0 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fam171bQ14CH0 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fam171bQ14CH0 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fam171bQ14CH0 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fam171bQ14CH0 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fam171bQ14CH0 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fam171bQ14CH0 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fam171bQ14CH0 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fam171bQ14CH0 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Fam171bQ14CH0 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Fam171bQ14CH0 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fam171bQ14CH0 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fam171bQ14CH0 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fam171bQ14CH0 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fam171bQ14CH0 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fam171bQ14CH0 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
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