Protein–RNA interactions for Protein: Q14BI7

Tdrd9, ATP-dependent RNA helicase TDRD9, mousemouse

Predictions only

Length 1,383 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd9Q14BI7 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Tdrd9Q14BI7 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tdrd9Q14BI7 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tdrd9Q14BI7 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tdrd9Q14BI7 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tdrd9Q14BI7 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tdrd9Q14BI7 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tdrd9Q14BI7 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tdrd9Q14BI7 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tdrd9Q14BI7 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tdrd9Q14BI7 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tdrd9Q14BI7 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Tdrd9Q14BI7 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tdrd9Q14BI7 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tdrd9Q14BI7 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tdrd9Q14BI7 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tdrd9Q14BI7 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tdrd9Q14BI7 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tdrd9Q14BI7 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tdrd9Q14BI7 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tdrd9Q14BI7 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tdrd9Q14BI7 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Tdrd9Q14BI7 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tdrd9Q14BI7 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tdrd9Q14BI7 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tdrd9Q14BI7 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tdrd9Q14BI7 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tdrd9Q14BI7 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tdrd9Q14BI7 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Tdrd9Q14BI7 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tdrd9Q14BI7 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tdrd9Q14BI7 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tdrd9Q14BI7 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tdrd9Q14BI7 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Tdrd9Q14BI7 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tdrd9Q14BI7 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tdrd9Q14BI7 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tdrd9Q14BI7 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tdrd9Q14BI7 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tdrd9Q14BI7 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tdrd9Q14BI7 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tdrd9Q14BI7 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tdrd9Q14BI7 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tdrd9Q14BI7 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tdrd9Q14BI7 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tdrd9Q14BI7 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tdrd9Q14BI7 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tdrd9Q14BI7 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tdrd9Q14BI7 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tdrd9Q14BI7 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Tdrd9Q14BI7 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tdrd9Q14BI7 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tdrd9Q14BI7 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tdrd9Q14BI7 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tdrd9Q14BI7 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tdrd9Q14BI7 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tdrd9Q14BI7 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tdrd9Q14BI7 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tdrd9Q14BI7 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tdrd9Q14BI7 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Tdrd9Q14BI7 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
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Tdrd9Q14BI7 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
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Tdrd9Q14BI7 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tdrd9Q14BI7 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tdrd9Q14BI7 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tdrd9Q14BI7 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tdrd9Q14BI7 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tdrd9Q14BI7 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tdrd9Q14BI7 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tdrd9Q14BI7 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tdrd9Q14BI7 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tdrd9Q14BI7 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tdrd9Q14BI7 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tdrd9Q14BI7 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tdrd9Q14BI7 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tdrd9Q14BI7 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tdrd9Q14BI7 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tdrd9Q14BI7 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tdrd9Q14BI7 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Tdrd9Q14BI7 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tdrd9Q14BI7 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tdrd9Q14BI7 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tdrd9Q14BI7 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tdrd9Q14BI7 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tdrd9Q14BI7 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tdrd9Q14BI7 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tdrd9Q14BI7 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tdrd9Q14BI7 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tdrd9Q14BI7 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tdrd9Q14BI7 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tdrd9Q14BI7 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tdrd9Q14BI7 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tdrd9Q14BI7 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tdrd9Q14BI7 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tdrd9Q14BI7 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms