Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
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ptchd1Q14B62 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ptchd1Q14B62 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ptchd1Q14B62 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
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ptchd1Q14B62 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ptchd1Q14B62 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
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ptchd1Q14B62 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ptchd1Q14B62 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
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ptchd1Q14B62 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ptchd1Q14B62 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ptchd1Q14B62 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ptchd1Q14B62 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ptchd1Q14B62 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ptchd1Q14B62 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ptchd1Q14B62 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
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ptchd1Q14B62 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
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ptchd1Q14B62 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
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ptchd1Q14B62 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
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ptchd1Q14B62 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ptchd1Q14B62 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
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ptchd1Q14B62 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ptchd1Q14B62 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
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ptchd1Q14B62 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
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ptchd1Q14B62 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
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ptchd1Q14B62 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ptchd1Q14B62 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ptchd1Q14B62 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
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ptchd1Q14B62 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ptchd1Q14B62 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ptchd1Q14B62 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ptchd1Q14B62 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ptchd1Q14B62 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ptchd1Q14B62 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ptchd1Q14B62 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ptchd1Q14B62 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ptchd1Q14B62 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ptchd1Q14B62 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ptchd1Q14B62 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ptchd1Q14B62 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ptchd1Q14B62 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ptchd1Q14B62 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ptchd1Q14B62 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ptchd1Q14B62 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ptchd1Q14B62 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ptchd1Q14B62 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
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