Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rpusd2Q149F1 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rpusd2Q149F1 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rpusd2Q149F1 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rpusd2Q149F1 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rpusd2Q149F1 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rpusd2Q149F1 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rpusd2Q149F1 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rpusd2Q149F1 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rpusd2Q149F1 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Rpusd2Q149F1 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rpusd2Q149F1 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rpusd2Q149F1 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rpusd2Q149F1 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rpusd2Q149F1 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rpusd2Q149F1 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rpusd2Q149F1 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rpusd2Q149F1 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Rpusd2Q149F1 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rpusd2Q149F1 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rpusd2Q149F1 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rpusd2Q149F1 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rpusd2Q149F1 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rpusd2Q149F1 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rpusd2Q149F1 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rpusd2Q149F1 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rpusd2Q149F1 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rpusd2Q149F1 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rpusd2Q149F1 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rpusd2Q149F1 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rpusd2Q149F1 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rpusd2Q149F1 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rpusd2Q149F1 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rpusd2Q149F1 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rpusd2Q149F1 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rpusd2Q149F1 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rpusd2Q149F1 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rpusd2Q149F1 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rpusd2Q149F1 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Rpusd2Q149F1 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rpusd2Q149F1 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rpusd2Q149F1 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rpusd2Q149F1 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rpusd2Q149F1 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rpusd2Q149F1 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rpusd2Q149F1 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Rpusd2Q149F1 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rpusd2Q149F1 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rpusd2Q149F1 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rpusd2Q149F1 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rpusd2Q149F1 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rpusd2Q149F1 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rpusd2Q149F1 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rpusd2Q149F1 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rpusd2Q149F1 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rpusd2Q149F1 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rpusd2Q149F1 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Rpusd2Q149F1 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rpusd2Q149F1 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rpusd2Q149F1 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rpusd2Q149F1 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rpusd2Q149F1 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rpusd2Q149F1 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rpusd2Q149F1 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rpusd2Q149F1 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rpusd2Q149F1 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rpusd2Q149F1 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rpusd2Q149F1 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rpusd2Q149F1 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rpusd2Q149F1 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rpusd2Q149F1 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rpusd2Q149F1 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rpusd2Q149F1 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rpusd2Q149F1 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rpusd2Q149F1 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rpusd2Q149F1 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rpusd2Q149F1 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rpusd2Q149F1 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rpusd2Q149F1 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rpusd2Q149F1 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rpusd2Q149F1 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rpusd2Q149F1 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rpusd2Q149F1 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Rpusd2Q149F1 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rpusd2Q149F1 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rpusd2Q149F1 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rpusd2Q149F1 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rpusd2Q149F1 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rpusd2Q149F1 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rpusd2Q149F1 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rpusd2Q149F1 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rpusd2Q149F1 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rpusd2Q149F1 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rpusd2Q149F1 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rpusd2Q149F1 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rpusd2Q149F1 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rpusd2Q149F1 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rpusd2Q149F1 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Rpusd2Q149F1 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Rpusd2Q149F1 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.2 ms