Protein–RNA interactions for Protein: Q0VE82

Cpne7, Copine-7, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne7Q0VE82 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cpne7Q0VE82 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cpne7Q0VE82 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cpne7Q0VE82 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cpne7Q0VE82 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cpne7Q0VE82 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cpne7Q0VE82 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cpne7Q0VE82 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cpne7Q0VE82 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cpne7Q0VE82 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cpne7Q0VE82 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cpne7Q0VE82 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cpne7Q0VE82 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cpne7Q0VE82 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cpne7Q0VE82 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cpne7Q0VE82 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cpne7Q0VE82 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cpne7Q0VE82 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cpne7Q0VE82 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cpne7Q0VE82 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cpne7Q0VE82 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cpne7Q0VE82 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cpne7Q0VE82 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cpne7Q0VE82 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cpne7Q0VE82 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cpne7Q0VE82 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cpne7Q0VE82 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cpne7Q0VE82 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cpne7Q0VE82 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cpne7Q0VE82 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cpne7Q0VE82 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cpne7Q0VE82 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cpne7Q0VE82 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Cpne7Q0VE82 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Cpne7Q0VE82 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cpne7Q0VE82 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Cpne7Q0VE82 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cpne7Q0VE82 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cpne7Q0VE82 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cpne7Q0VE82 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cpne7Q0VE82 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cpne7Q0VE82 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cpne7Q0VE82 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cpne7Q0VE82 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Cpne7Q0VE82 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cpne7Q0VE82 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cpne7Q0VE82 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cpne7Q0VE82 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cpne7Q0VE82 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cpne7Q0VE82 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cpne7Q0VE82 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cpne7Q0VE82 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cpne7Q0VE82 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cpne7Q0VE82 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cpne7Q0VE82 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cpne7Q0VE82 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cpne7Q0VE82 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cpne7Q0VE82 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cpne7Q0VE82 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cpne7Q0VE82 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cpne7Q0VE82 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cpne7Q0VE82 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cpne7Q0VE82 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cpne7Q0VE82 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cpne7Q0VE82 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cpne7Q0VE82 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cpne7Q0VE82 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cpne7Q0VE82 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cpne7Q0VE82 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cpne7Q0VE82 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cpne7Q0VE82 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cpne7Q0VE82 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cpne7Q0VE82 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cpne7Q0VE82 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cpne7Q0VE82 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cpne7Q0VE82 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Cpne7Q0VE82 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cpne7Q0VE82 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Cpne7Q0VE82 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Cpne7Q0VE82 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Cpne7Q0VE82 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cpne7Q0VE82 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cpne7Q0VE82 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cpne7Q0VE82 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cpne7Q0VE82 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Cpne7Q0VE82 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cpne7Q0VE82 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cpne7Q0VE82 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cpne7Q0VE82 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cpne7Q0VE82 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cpne7Q0VE82 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cpne7Q0VE82 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cpne7Q0VE82 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cpne7Q0VE82 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cpne7Q0VE82 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cpne7Q0VE82 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cpne7Q0VE82 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cpne7Q0VE82 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cpne7Q0VE82 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cpne7Q0VE82 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.1 ms