Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBF8

Stum, Protein stum homolog, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
StumQ0VBF8 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
StumQ0VBF8 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
StumQ0VBF8 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
StumQ0VBF8 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
StumQ0VBF8 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
StumQ0VBF8 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
StumQ0VBF8 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
StumQ0VBF8 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
StumQ0VBF8 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
StumQ0VBF8 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
StumQ0VBF8 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
StumQ0VBF8 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
StumQ0VBF8 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
StumQ0VBF8 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
StumQ0VBF8 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
StumQ0VBF8 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
StumQ0VBF8 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
StumQ0VBF8 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
StumQ0VBF8 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
StumQ0VBF8 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
StumQ0VBF8 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
StumQ0VBF8 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
StumQ0VBF8 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
StumQ0VBF8 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
StumQ0VBF8 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
StumQ0VBF8 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
StumQ0VBF8 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
StumQ0VBF8 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
StumQ0VBF8 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
StumQ0VBF8 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
StumQ0VBF8 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
StumQ0VBF8 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
StumQ0VBF8 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
StumQ0VBF8 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
StumQ0VBF8 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
StumQ0VBF8 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
StumQ0VBF8 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
StumQ0VBF8 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
StumQ0VBF8 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
StumQ0VBF8 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
StumQ0VBF8 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
StumQ0VBF8 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
StumQ0VBF8 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
StumQ0VBF8 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
StumQ0VBF8 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
StumQ0VBF8 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
StumQ0VBF8 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
StumQ0VBF8 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
StumQ0VBF8 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
StumQ0VBF8 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
StumQ0VBF8 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
StumQ0VBF8 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
StumQ0VBF8 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
StumQ0VBF8 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
StumQ0VBF8 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
StumQ0VBF8 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
StumQ0VBF8 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
StumQ0VBF8 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
StumQ0VBF8 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
StumQ0VBF8 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
StumQ0VBF8 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
StumQ0VBF8 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
StumQ0VBF8 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
StumQ0VBF8 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
StumQ0VBF8 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
StumQ0VBF8 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
StumQ0VBF8 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
StumQ0VBF8 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
StumQ0VBF8 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
StumQ0VBF8 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
StumQ0VBF8 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
StumQ0VBF8 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
StumQ0VBF8 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC14.21□□□□□ -0.14
StumQ0VBF8 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
StumQ0VBF8 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
StumQ0VBF8 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
StumQ0VBF8 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
StumQ0VBF8 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
StumQ0VBF8 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
StumQ0VBF8 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
StumQ0VBF8 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
StumQ0VBF8 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
StumQ0VBF8 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
StumQ0VBF8 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
StumQ0VBF8 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
StumQ0VBF8 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
StumQ0VBF8 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
StumQ0VBF8 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
StumQ0VBF8 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
StumQ0VBF8 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
StumQ0VBF8 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
StumQ0VBF8 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
StumQ0VBF8 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
StumQ0VBF8 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
StumQ0VBF8 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
StumQ0VBF8 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
StumQ0VBF8 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
StumQ0VBF8 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
StumQ0VBF8 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
StumQ0VBF8 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms