Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBD0

Itgb8, Integrin beta, mousemouse

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb8Q0VBD0 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Itgb8Q0VBD0 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Itgb8Q0VBD0 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Itgb8Q0VBD0 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Itgb8Q0VBD0 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Itgb8Q0VBD0 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Itgb8Q0VBD0 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Itgb8Q0VBD0 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Itgb8Q0VBD0 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Itgb8Q0VBD0 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Itgb8Q0VBD0 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Itgb8Q0VBD0 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Itgb8Q0VBD0 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Itgb8Q0VBD0 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Itgb8Q0VBD0 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Itgb8Q0VBD0 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Itgb8Q0VBD0 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Itgb8Q0VBD0 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Itgb8Q0VBD0 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Itgb8Q0VBD0 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Itgb8Q0VBD0 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Itgb8Q0VBD0 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Itgb8Q0VBD0 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Itgb8Q0VBD0 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Itgb8Q0VBD0 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Itgb8Q0VBD0 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Itgb8Q0VBD0 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Itgb8Q0VBD0 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Itgb8Q0VBD0 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Itgb8Q0VBD0 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Itgb8Q0VBD0 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Itgb8Q0VBD0 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Itgb8Q0VBD0 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Itgb8Q0VBD0 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Itgb8Q0VBD0 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Itgb8Q0VBD0 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Itgb8Q0VBD0 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Itgb8Q0VBD0 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Itgb8Q0VBD0 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Itgb8Q0VBD0 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Itgb8Q0VBD0 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Itgb8Q0VBD0 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Itgb8Q0VBD0 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Itgb8Q0VBD0 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Itgb8Q0VBD0 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Itgb8Q0VBD0 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Itgb8Q0VBD0 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Itgb8Q0VBD0 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Itgb8Q0VBD0 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Itgb8Q0VBD0 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Itgb8Q0VBD0 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Itgb8Q0VBD0 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Itgb8Q0VBD0 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Itgb8Q0VBD0 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Itgb8Q0VBD0 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Itgb8Q0VBD0 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Itgb8Q0VBD0 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Itgb8Q0VBD0 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Itgb8Q0VBD0 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Itgb8Q0VBD0 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Itgb8Q0VBD0 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Itgb8Q0VBD0 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Itgb8Q0VBD0 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Itgb8Q0VBD0 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Itgb8Q0VBD0 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Itgb8Q0VBD0 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Itgb8Q0VBD0 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Itgb8Q0VBD0 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Itgb8Q0VBD0 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Itgb8Q0VBD0 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Itgb8Q0VBD0 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Itgb8Q0VBD0 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Itgb8Q0VBD0 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Itgb8Q0VBD0 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Itgb8Q0VBD0 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Itgb8Q0VBD0 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Itgb8Q0VBD0 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Itgb8Q0VBD0 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Itgb8Q0VBD0 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Itgb8Q0VBD0 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Itgb8Q0VBD0 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Itgb8Q0VBD0 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Itgb8Q0VBD0 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Itgb8Q0VBD0 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Itgb8Q0VBD0 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Itgb8Q0VBD0 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Itgb8Q0VBD0 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Itgb8Q0VBD0 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Itgb8Q0VBD0 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Itgb8Q0VBD0 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Itgb8Q0VBD0 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Itgb8Q0VBD0 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Itgb8Q0VBD0 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Itgb8Q0VBD0 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Itgb8Q0VBD0 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Itgb8Q0VBD0 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Itgb8Q0VBD0 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Itgb8Q0VBD0 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Itgb8Q0VBD0 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Itgb8Q0VBD0 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms