Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL02

Trio, Triple functional domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 3,102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrioQ0KL02 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TrioQ0KL02 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TrioQ0KL02 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TrioQ0KL02 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TrioQ0KL02 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TrioQ0KL02 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TrioQ0KL02 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TrioQ0KL02 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TrioQ0KL02 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TrioQ0KL02 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TrioQ0KL02 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TrioQ0KL02 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TrioQ0KL02 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TrioQ0KL02 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TrioQ0KL02 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TrioQ0KL02 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TrioQ0KL02 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TrioQ0KL02 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TrioQ0KL02 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TrioQ0KL02 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TrioQ0KL02 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TrioQ0KL02 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TrioQ0KL02 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TrioQ0KL02 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TrioQ0KL02 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TrioQ0KL02 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TrioQ0KL02 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TrioQ0KL02 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TrioQ0KL02 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TrioQ0KL02 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TrioQ0KL02 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TrioQ0KL02 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TrioQ0KL02 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TrioQ0KL02 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TrioQ0KL02 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TrioQ0KL02 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TrioQ0KL02 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TrioQ0KL02 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TrioQ0KL02 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TrioQ0KL02 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TrioQ0KL02 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TrioQ0KL02 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TrioQ0KL02 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TrioQ0KL02 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TrioQ0KL02 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TrioQ0KL02 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TrioQ0KL02 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TrioQ0KL02 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TrioQ0KL02 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TrioQ0KL02 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TrioQ0KL02 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TrioQ0KL02 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TrioQ0KL02 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TrioQ0KL02 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TrioQ0KL02 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TrioQ0KL02 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TrioQ0KL02 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.34
TrioQ0KL02 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
TrioQ0KL02 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
TrioQ0KL02 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TrioQ0KL02 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TrioQ0KL02 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TrioQ0KL02 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TrioQ0KL02 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TrioQ0KL02 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TrioQ0KL02 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TrioQ0KL02 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TrioQ0KL02 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TrioQ0KL02 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TrioQ0KL02 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TrioQ0KL02 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TrioQ0KL02 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TrioQ0KL02 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TrioQ0KL02 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TrioQ0KL02 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
TrioQ0KL02 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
TrioQ0KL02 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TrioQ0KL02 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TrioQ0KL02 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TrioQ0KL02 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TrioQ0KL02 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TrioQ0KL02 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TrioQ0KL02 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TrioQ0KL02 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TrioQ0KL02 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TrioQ0KL02 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TrioQ0KL02 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TrioQ0KL02 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TrioQ0KL02 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
TrioQ0KL02 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TrioQ0KL02 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TrioQ0KL02 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TrioQ0KL02 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TrioQ0KL02 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TrioQ0KL02 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TrioQ0KL02 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TrioQ0KL02 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
TrioQ0KL02 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
TrioQ0KL02 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TrioQ0KL02 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms