Protein–RNA interactions for Protein: Q0GGX2

Znf541, Zinc finger protein 541, mousemouse

Predictions only

Length 1,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf541Q0GGX2 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Znf541Q0GGX2 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Znf541Q0GGX2 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Znf541Q0GGX2 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Znf541Q0GGX2 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Znf541Q0GGX2 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Znf541Q0GGX2 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Znf541Q0GGX2 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Znf541Q0GGX2 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Znf541Q0GGX2 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Znf541Q0GGX2 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Znf541Q0GGX2 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Znf541Q0GGX2 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Znf541Q0GGX2 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Znf541Q0GGX2 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Znf541Q0GGX2 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Znf541Q0GGX2 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Znf541Q0GGX2 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Znf541Q0GGX2 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Znf541Q0GGX2 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Znf541Q0GGX2 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Znf541Q0GGX2 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Znf541Q0GGX2 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Znf541Q0GGX2 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Znf541Q0GGX2 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Znf541Q0GGX2 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Znf541Q0GGX2 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Znf541Q0GGX2 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Znf541Q0GGX2 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Znf541Q0GGX2 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Znf541Q0GGX2 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Znf541Q0GGX2 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Znf541Q0GGX2 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Znf541Q0GGX2 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Znf541Q0GGX2 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Znf541Q0GGX2 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Znf541Q0GGX2 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Znf541Q0GGX2 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Znf541Q0GGX2 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Znf541Q0GGX2 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Znf541Q0GGX2 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Znf541Q0GGX2 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Znf541Q0GGX2 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Znf541Q0GGX2 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Znf541Q0GGX2 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Znf541Q0GGX2 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Znf541Q0GGX2 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Znf541Q0GGX2 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Znf541Q0GGX2 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Znf541Q0GGX2 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Znf541Q0GGX2 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Znf541Q0GGX2 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Znf541Q0GGX2 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Znf541Q0GGX2 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Znf541Q0GGX2 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Znf541Q0GGX2 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Znf541Q0GGX2 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Znf541Q0GGX2 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Znf541Q0GGX2 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Znf541Q0GGX2 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Znf541Q0GGX2 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Znf541Q0GGX2 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Znf541Q0GGX2 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Znf541Q0GGX2 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Znf541Q0GGX2 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Znf541Q0GGX2 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Znf541Q0GGX2 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Znf541Q0GGX2 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Znf541Q0GGX2 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Znf541Q0GGX2 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Znf541Q0GGX2 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Znf541Q0GGX2 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Znf541Q0GGX2 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Znf541Q0GGX2 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Znf541Q0GGX2 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Znf541Q0GGX2 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Znf541Q0GGX2 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Znf541Q0GGX2 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Znf541Q0GGX2 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Znf541Q0GGX2 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Znf541Q0GGX2 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Znf541Q0GGX2 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Znf541Q0GGX2 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Znf541Q0GGX2 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Znf541Q0GGX2 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Znf541Q0GGX2 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Znf541Q0GGX2 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Znf541Q0GGX2 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Znf541Q0GGX2 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Znf541Q0GGX2 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Znf541Q0GGX2 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Znf541Q0GGX2 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Znf541Q0GGX2 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Znf541Q0GGX2 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Znf541Q0GGX2 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Znf541Q0GGX2 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Znf541Q0GGX2 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Znf541Q0GGX2 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Znf541Q0GGX2 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Znf541Q0GGX2 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms