Protein–RNA interactions for Protein: Q08EE8

1700061G19Rik, RIKEN cDNA 1700061G19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700061G19RikQ08EE8 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
1700061G19RikQ08EE8 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
1700061G19RikQ08EE8 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
1700061G19RikQ08EE8 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
1700061G19RikQ08EE8 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
1700061G19RikQ08EE8 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
1700061G19RikQ08EE8 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
1700061G19RikQ08EE8 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
1700061G19RikQ08EE8 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
1700061G19RikQ08EE8 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
1700061G19RikQ08EE8 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
1700061G19RikQ08EE8 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
1700061G19RikQ08EE8 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
1700061G19RikQ08EE8 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
1700061G19RikQ08EE8 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
1700061G19RikQ08EE8 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
1700061G19RikQ08EE8 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
1700061G19RikQ08EE8 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
1700061G19RikQ08EE8 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
1700061G19RikQ08EE8 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
1700061G19RikQ08EE8 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
1700061G19RikQ08EE8 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
1700061G19RikQ08EE8 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
1700061G19RikQ08EE8 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
1700061G19RikQ08EE8 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
1700061G19RikQ08EE8 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
1700061G19RikQ08EE8 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17■□□□□ 0.31
1700061G19RikQ08EE8 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
1700061G19RikQ08EE8 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
1700061G19RikQ08EE8 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
1700061G19RikQ08EE8 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
1700061G19RikQ08EE8 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
1700061G19RikQ08EE8 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
1700061G19RikQ08EE8 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
1700061G19RikQ08EE8 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
1700061G19RikQ08EE8 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
1700061G19RikQ08EE8 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
1700061G19RikQ08EE8 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
1700061G19RikQ08EE8 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
1700061G19RikQ08EE8 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
1700061G19RikQ08EE8 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
1700061G19RikQ08EE8 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
1700061G19RikQ08EE8 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
1700061G19RikQ08EE8 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
1700061G19RikQ08EE8 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
1700061G19RikQ08EE8 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
1700061G19RikQ08EE8 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
1700061G19RikQ08EE8 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
1700061G19RikQ08EE8 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
1700061G19RikQ08EE8 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
1700061G19RikQ08EE8 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
1700061G19RikQ08EE8 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
1700061G19RikQ08EE8 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
1700061G19RikQ08EE8 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
1700061G19RikQ08EE8 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
1700061G19RikQ08EE8 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
1700061G19RikQ08EE8 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
1700061G19RikQ08EE8 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
1700061G19RikQ08EE8 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
1700061G19RikQ08EE8 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
1700061G19RikQ08EE8 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
1700061G19RikQ08EE8 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
1700061G19RikQ08EE8 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
1700061G19RikQ08EE8 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
1700061G19RikQ08EE8 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
1700061G19RikQ08EE8 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
1700061G19RikQ08EE8 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
1700061G19RikQ08EE8 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
1700061G19RikQ08EE8 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
1700061G19RikQ08EE8 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
1700061G19RikQ08EE8 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
1700061G19RikQ08EE8 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
1700061G19RikQ08EE8 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
1700061G19RikQ08EE8 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
1700061G19RikQ08EE8 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
1700061G19RikQ08EE8 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
1700061G19RikQ08EE8 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
1700061G19RikQ08EE8 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
1700061G19RikQ08EE8 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
1700061G19RikQ08EE8 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
1700061G19RikQ08EE8 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
1700061G19RikQ08EE8 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
1700061G19RikQ08EE8 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
1700061G19RikQ08EE8 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
1700061G19RikQ08EE8 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
1700061G19RikQ08EE8 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
1700061G19RikQ08EE8 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
1700061G19RikQ08EE8 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
1700061G19RikQ08EE8 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
1700061G19RikQ08EE8 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
1700061G19RikQ08EE8 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
1700061G19RikQ08EE8 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
1700061G19RikQ08EE8 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
1700061G19RikQ08EE8 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
1700061G19RikQ08EE8 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
1700061G19RikQ08EE8 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
1700061G19RikQ08EE8 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
1700061G19RikQ08EE8 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
1700061G19RikQ08EE8 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
1700061G19RikQ08EE8 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms