Protein–RNA interactions for Protein: Q08624

Hoxc4, Homeobox protein Hox-C4, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc4Q08624 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxc4Q08624 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxc4Q08624 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxc4Q08624 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxc4Q08624 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxc4Q08624 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxc4Q08624 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxc4Q08624 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxc4Q08624 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxc4Q08624 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxc4Q08624 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxc4Q08624 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxc4Q08624 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxc4Q08624 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxc4Q08624 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxc4Q08624 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxc4Q08624 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxc4Q08624 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxc4Q08624 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxc4Q08624 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxc4Q08624 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxc4Q08624 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxc4Q08624 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxc4Q08624 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxc4Q08624 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxc4Q08624 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxc4Q08624 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxc4Q08624 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxc4Q08624 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxc4Q08624 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxc4Q08624 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxc4Q08624 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxc4Q08624 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxc4Q08624 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxc4Q08624 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxc4Q08624 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxc4Q08624 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxc4Q08624 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxc4Q08624 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxc4Q08624 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxc4Q08624 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxc4Q08624 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxc4Q08624 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxc4Q08624 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxc4Q08624 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxc4Q08624 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxc4Q08624 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxc4Q08624 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxc4Q08624 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxc4Q08624 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxc4Q08624 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxc4Q08624 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxc4Q08624 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxc4Q08624 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxc4Q08624 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxc4Q08624 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxc4Q08624 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxc4Q08624 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxc4Q08624 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxc4Q08624 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxc4Q08624 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxc4Q08624 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxc4Q08624 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxc4Q08624 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxc4Q08624 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxc4Q08624 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxc4Q08624 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxc4Q08624 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxc4Q08624 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxc4Q08624 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxc4Q08624 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxc4Q08624 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxc4Q08624 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxc4Q08624 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxc4Q08624 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxc4Q08624 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxc4Q08624 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxc4Q08624 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxc4Q08624 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxc4Q08624 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxc4Q08624 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxc4Q08624 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxc4Q08624 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxc4Q08624 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxc4Q08624 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxc4Q08624 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxc4Q08624 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxc4Q08624 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxc4Q08624 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxc4Q08624 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxc4Q08624 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxc4Q08624 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxc4Q08624 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxc4Q08624 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxc4Q08624 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxc4Q08624 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxc4Q08624 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxc4Q08624 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxc4Q08624 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxc4Q08624 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms