Protein–RNA interactions for Protein: Q08189

Tgm3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, mousemouse

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm3Q08189 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Tgm3Q08189 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tgm3Q08189 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Tgm3Q08189 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tgm3Q08189 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tgm3Q08189 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tgm3Q08189 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tgm3Q08189 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tgm3Q08189 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Tgm3Q08189 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tgm3Q08189 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tgm3Q08189 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tgm3Q08189 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tgm3Q08189 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tgm3Q08189 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tgm3Q08189 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tgm3Q08189 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tgm3Q08189 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tgm3Q08189 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tgm3Q08189 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tgm3Q08189 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tgm3Q08189 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tgm3Q08189 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tgm3Q08189 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tgm3Q08189 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tgm3Q08189 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tgm3Q08189 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tgm3Q08189 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tgm3Q08189 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tgm3Q08189 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tgm3Q08189 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tgm3Q08189 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tgm3Q08189 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tgm3Q08189 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tgm3Q08189 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tgm3Q08189 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tgm3Q08189 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tgm3Q08189 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tgm3Q08189 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tgm3Q08189 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tgm3Q08189 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tgm3Q08189 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tgm3Q08189 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tgm3Q08189 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tgm3Q08189 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tgm3Q08189 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tgm3Q08189 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tgm3Q08189 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tgm3Q08189 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tgm3Q08189 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tgm3Q08189 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tgm3Q08189 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tgm3Q08189 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tgm3Q08189 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tgm3Q08189 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tgm3Q08189 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tgm3Q08189 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tgm3Q08189 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tgm3Q08189 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tgm3Q08189 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tgm3Q08189 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tgm3Q08189 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tgm3Q08189 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Tgm3Q08189 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tgm3Q08189 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tgm3Q08189 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tgm3Q08189 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tgm3Q08189 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tgm3Q08189 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tgm3Q08189 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tgm3Q08189 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tgm3Q08189 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tgm3Q08189 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tgm3Q08189 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tgm3Q08189 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tgm3Q08189 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Tgm3Q08189 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tgm3Q08189 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Tgm3Q08189 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tgm3Q08189 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Tgm3Q08189 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tgm3Q08189 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tgm3Q08189 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tgm3Q08189 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tgm3Q08189 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tgm3Q08189 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tgm3Q08189 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tgm3Q08189 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tgm3Q08189 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tgm3Q08189 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Tgm3Q08189 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tgm3Q08189 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tgm3Q08189 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tgm3Q08189 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tgm3Q08189 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Tgm3Q08189 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tgm3Q08189 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tgm3Q08189 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tgm3Q08189 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tgm3Q08189 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms