Protein–RNA interactions for Protein: Q07643

Col9a2, Collagen alpha-2(IX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a2Q07643 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Col9a2Q07643 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Col9a2Q07643 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Col9a2Q07643 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Col9a2Q07643 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Col9a2Q07643 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Col9a2Q07643 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Col9a2Q07643 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Col9a2Q07643 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Col9a2Q07643 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Col9a2Q07643 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Col9a2Q07643 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Col9a2Q07643 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Col9a2Q07643 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Col9a2Q07643 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Col9a2Q07643 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Col9a2Q07643 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Col9a2Q07643 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Col9a2Q07643 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Col9a2Q07643 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Col9a2Q07643 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Col9a2Q07643 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Col9a2Q07643 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Col9a2Q07643 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Col9a2Q07643 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Col9a2Q07643 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Col9a2Q07643 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Col9a2Q07643 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Col9a2Q07643 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Col9a2Q07643 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Col9a2Q07643 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Col9a2Q07643 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Col9a2Q07643 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Col9a2Q07643 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Col9a2Q07643 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Col9a2Q07643 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Col9a2Q07643 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Col9a2Q07643 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Col9a2Q07643 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Col9a2Q07643 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Col9a2Q07643 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Col9a2Q07643 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Col9a2Q07643 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Col9a2Q07643 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Col9a2Q07643 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Col9a2Q07643 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Col9a2Q07643 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Col9a2Q07643 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Col9a2Q07643 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Col9a2Q07643 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Col9a2Q07643 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Col9a2Q07643 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Col9a2Q07643 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Col9a2Q07643 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Col9a2Q07643 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Col9a2Q07643 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Col9a2Q07643 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Col9a2Q07643 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Col9a2Q07643 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Col9a2Q07643 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Col9a2Q07643 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Col9a2Q07643 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Col9a2Q07643 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Col9a2Q07643 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Col9a2Q07643 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Col9a2Q07643 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Col9a2Q07643 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Col9a2Q07643 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Col9a2Q07643 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Col9a2Q07643 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Col9a2Q07643 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Col9a2Q07643 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Col9a2Q07643 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Col9a2Q07643 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Col9a2Q07643 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Col9a2Q07643 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Col9a2Q07643 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Col9a2Q07643 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Col9a2Q07643 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Col9a2Q07643 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Col9a2Q07643 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Col9a2Q07643 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Col9a2Q07643 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Col9a2Q07643 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Col9a2Q07643 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Col9a2Q07643 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Col9a2Q07643 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Col9a2Q07643 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Col9a2Q07643 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Col9a2Q07643 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Col9a2Q07643 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Col9a2Q07643 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Col9a2Q07643 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Col9a2Q07643 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Col9a2Q07643 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Col9a2Q07643 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Col9a2Q07643 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Col9a2Q07643 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Col9a2Q07643 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Col9a2Q07643 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.7 ms