Protein–RNA interactions for Protein: Q07104

Gdf3, Growth/differentiation factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf3Q07104 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gdf3Q07104 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gdf3Q07104 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gdf3Q07104 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gdf3Q07104 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gdf3Q07104 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gdf3Q07104 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gdf3Q07104 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gdf3Q07104 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gdf3Q07104 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gdf3Q07104 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gdf3Q07104 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gdf3Q07104 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gdf3Q07104 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gdf3Q07104 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gdf3Q07104 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gdf3Q07104 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gdf3Q07104 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gdf3Q07104 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gdf3Q07104 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gdf3Q07104 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gdf3Q07104 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gdf3Q07104 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gdf3Q07104 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gdf3Q07104 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gdf3Q07104 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gdf3Q07104 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gdf3Q07104 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gdf3Q07104 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gdf3Q07104 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gdf3Q07104 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gdf3Q07104 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gdf3Q07104 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gdf3Q07104 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gdf3Q07104 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gdf3Q07104 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gdf3Q07104 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gdf3Q07104 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gdf3Q07104 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gdf3Q07104 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gdf3Q07104 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gdf3Q07104 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gdf3Q07104 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gdf3Q07104 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gdf3Q07104 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gdf3Q07104 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gdf3Q07104 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gdf3Q07104 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gdf3Q07104 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gdf3Q07104 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gdf3Q07104 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gdf3Q07104 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gdf3Q07104 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gdf3Q07104 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gdf3Q07104 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gdf3Q07104 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gdf3Q07104 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gdf3Q07104 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gdf3Q07104 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gdf3Q07104 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gdf3Q07104 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gdf3Q07104 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gdf3Q07104 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gdf3Q07104 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gdf3Q07104 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gdf3Q07104 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gdf3Q07104 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gdf3Q07104 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gdf3Q07104 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gdf3Q07104 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gdf3Q07104 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gdf3Q07104 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gdf3Q07104 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gdf3Q07104 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gdf3Q07104 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gdf3Q07104 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gdf3Q07104 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gdf3Q07104 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gdf3Q07104 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gdf3Q07104 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gdf3Q07104 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gdf3Q07104 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gdf3Q07104 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gdf3Q07104 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gdf3Q07104 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gdf3Q07104 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gdf3Q07104 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gdf3Q07104 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gdf3Q07104 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gdf3Q07104 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gdf3Q07104 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gdf3Q07104 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gdf3Q07104 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gdf3Q07104 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gdf3Q07104 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gdf3Q07104 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gdf3Q07104 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gdf3Q07104 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gdf3Q07104 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gdf3Q07104 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.1 ms