Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Siah1bQ06985 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Siah1bQ06985 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Siah1bQ06985 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Siah1bQ06985 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Siah1bQ06985 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Siah1bQ06985 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Siah1bQ06985 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Siah1bQ06985 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Siah1bQ06985 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Siah1bQ06985 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Siah1bQ06985 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Siah1bQ06985 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Siah1bQ06985 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Siah1bQ06985 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Siah1bQ06985 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Siah1bQ06985 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Siah1bQ06985 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Siah1bQ06985 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Siah1bQ06985 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Siah1bQ06985 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Siah1bQ06985 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Siah1bQ06985 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Siah1bQ06985 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Siah1bQ06985 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Siah1bQ06985 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Siah1bQ06985 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Siah1bQ06985 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Siah1bQ06985 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Siah1bQ06985 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Siah1bQ06985 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Siah1bQ06985 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Siah1bQ06985 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Siah1bQ06985 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Siah1bQ06985 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Siah1bQ06985 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Siah1bQ06985 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Siah1bQ06985 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Siah1bQ06985 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Siah1bQ06985 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Siah1bQ06985 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Siah1bQ06985 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Siah1bQ06985 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Siah1bQ06985 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Siah1bQ06985 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Siah1bQ06985 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Siah1bQ06985 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Siah1bQ06985 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Siah1bQ06985 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Siah1bQ06985 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Siah1bQ06985 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Siah1bQ06985 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Siah1bQ06985 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Siah1bQ06985 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Siah1bQ06985 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Siah1bQ06985 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Siah1bQ06985 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Siah1bQ06985 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Siah1bQ06985 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Siah1bQ06985 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Siah1bQ06985 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Siah1bQ06985 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Siah1bQ06985 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Siah1bQ06985 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Siah1bQ06985 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Siah1bQ06985 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Siah1bQ06985 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Siah1bQ06985 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Siah1bQ06985 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Siah1bQ06985 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Siah1bQ06985 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Siah1bQ06985 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Siah1bQ06985 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Siah1bQ06985 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Siah1bQ06985 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Siah1bQ06985 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Siah1bQ06985 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Siah1bQ06985 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Siah1bQ06985 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Siah1bQ06985 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Siah1bQ06985 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Siah1bQ06985 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Siah1bQ06985 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Siah1bQ06985 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Siah1bQ06985 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Siah1bQ06985 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Siah1bQ06985 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Siah1bQ06985 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Siah1bQ06985 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Siah1bQ06985 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Siah1bQ06985 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Siah1bQ06985 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Siah1bQ06985 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Siah1bQ06985 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Siah1bQ06985 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Siah1bQ06985 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Siah1bQ06985 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Siah1bQ06985 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Siah1bQ06985 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Siah1bQ06985 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms