Protein–RNA interactions for Protein: Q06831

Sox4, Transcription factor SOX-4, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox4Q06831 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sox4Q06831 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sox4Q06831 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Sox4Q06831 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sox4Q06831 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sox4Q06831 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sox4Q06831 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sox4Q06831 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sox4Q06831 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sox4Q06831 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sox4Q06831 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sox4Q06831 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sox4Q06831 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sox4Q06831 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sox4Q06831 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sox4Q06831 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sox4Q06831 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sox4Q06831 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sox4Q06831 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sox4Q06831 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sox4Q06831 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sox4Q06831 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sox4Q06831 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sox4Q06831 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sox4Q06831 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sox4Q06831 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sox4Q06831 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sox4Q06831 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sox4Q06831 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sox4Q06831 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sox4Q06831 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sox4Q06831 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sox4Q06831 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sox4Q06831 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sox4Q06831 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sox4Q06831 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sox4Q06831 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sox4Q06831 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sox4Q06831 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sox4Q06831 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sox4Q06831 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sox4Q06831 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sox4Q06831 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sox4Q06831 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sox4Q06831 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sox4Q06831 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sox4Q06831 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sox4Q06831 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Sox4Q06831 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sox4Q06831 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sox4Q06831 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sox4Q06831 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sox4Q06831 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sox4Q06831 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sox4Q06831 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Sox4Q06831 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sox4Q06831 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sox4Q06831 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sox4Q06831 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sox4Q06831 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Sox4Q06831 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sox4Q06831 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sox4Q06831 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sox4Q06831 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sox4Q06831 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sox4Q06831 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sox4Q06831 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sox4Q06831 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sox4Q06831 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Sox4Q06831 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sox4Q06831 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sox4Q06831 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sox4Q06831 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sox4Q06831 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sox4Q06831 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sox4Q06831 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sox4Q06831 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sox4Q06831 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sox4Q06831 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sox4Q06831 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sox4Q06831 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sox4Q06831 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sox4Q06831 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sox4Q06831 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sox4Q06831 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sox4Q06831 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sox4Q06831 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sox4Q06831 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sox4Q06831 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sox4Q06831 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sox4Q06831 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sox4Q06831 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sox4Q06831 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Sox4Q06831 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sox4Q06831 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sox4Q06831 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sox4Q06831 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sox4Q06831 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sox4Q06831 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sox4Q06831 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms