Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Sh3bp2Q06649 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sh3bp2Q06649 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sh3bp2Q06649 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sh3bp2Q06649 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sh3bp2Q06649 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sh3bp2Q06649 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sh3bp2Q06649 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sh3bp2Q06649 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sh3bp2Q06649 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Sh3bp2Q06649 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sh3bp2Q06649 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Sh3bp2Q06649 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Sh3bp2Q06649 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Sh3bp2Q06649 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sh3bp2Q06649 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sh3bp2Q06649 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sh3bp2Q06649 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sh3bp2Q06649 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sh3bp2Q06649 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sh3bp2Q06649 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sh3bp2Q06649 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sh3bp2Q06649 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sh3bp2Q06649 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sh3bp2Q06649 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sh3bp2Q06649 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sh3bp2Q06649 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Sh3bp2Q06649 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sh3bp2Q06649 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sh3bp2Q06649 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sh3bp2Q06649 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sh3bp2Q06649 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sh3bp2Q06649 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sh3bp2Q06649 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sh3bp2Q06649 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sh3bp2Q06649 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sh3bp2Q06649 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sh3bp2Q06649 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sh3bp2Q06649 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sh3bp2Q06649 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sh3bp2Q06649 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Sh3bp2Q06649 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sh3bp2Q06649 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sh3bp2Q06649 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Sh3bp2Q06649 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Sh3bp2Q06649 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sh3bp2Q06649 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sh3bp2Q06649 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sh3bp2Q06649 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sh3bp2Q06649 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sh3bp2Q06649 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sh3bp2Q06649 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sh3bp2Q06649 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sh3bp2Q06649 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sh3bp2Q06649 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sh3bp2Q06649 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sh3bp2Q06649 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sh3bp2Q06649 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sh3bp2Q06649 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sh3bp2Q06649 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sh3bp2Q06649 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sh3bp2Q06649 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sh3bp2Q06649 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sh3bp2Q06649 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sh3bp2Q06649 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sh3bp2Q06649 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sh3bp2Q06649 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sh3bp2Q06649 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sh3bp2Q06649 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sh3bp2Q06649 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sh3bp2Q06649 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sh3bp2Q06649 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sh3bp2Q06649 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sh3bp2Q06649 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sh3bp2Q06649 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sh3bp2Q06649 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sh3bp2Q06649 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sh3bp2Q06649 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sh3bp2Q06649 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sh3bp2Q06649 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sh3bp2Q06649 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sh3bp2Q06649 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sh3bp2Q06649 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sh3bp2Q06649 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sh3bp2Q06649 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sh3bp2Q06649 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sh3bp2Q06649 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sh3bp2Q06649 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Sh3bp2Q06649 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sh3bp2Q06649 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Sh3bp2Q06649 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sh3bp2Q06649 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sh3bp2Q06649 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sh3bp2Q06649 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sh3bp2Q06649 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sh3bp2Q06649 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sh3bp2Q06649 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sh3bp2Q06649 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sh3bp2Q06649 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sh3bp2Q06649 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms