Protein–RNA interactions for Protein: Q06348

Prrx2, Paired mesoderm homeobox protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrx2Q06348 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Prrx2Q06348 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Prrx2Q06348 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Prrx2Q06348 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Prrx2Q06348 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Prrx2Q06348 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Prrx2Q06348 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Prrx2Q06348 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Prrx2Q06348 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Prrx2Q06348 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Prrx2Q06348 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Prrx2Q06348 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Prrx2Q06348 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Prrx2Q06348 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Prrx2Q06348 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Prrx2Q06348 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Prrx2Q06348 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Prrx2Q06348 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Prrx2Q06348 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Prrx2Q06348 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Prrx2Q06348 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Prrx2Q06348 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Prrx2Q06348 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Prrx2Q06348 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Prrx2Q06348 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Prrx2Q06348 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Prrx2Q06348 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.11
Prrx2Q06348 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Prrx2Q06348 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Prrx2Q06348 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Prrx2Q06348 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Prrx2Q06348 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Prrx2Q06348 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Prrx2Q06348 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Prrx2Q06348 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Prrx2Q06348 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Prrx2Q06348 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Prrx2Q06348 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Prrx2Q06348 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Prrx2Q06348 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Prrx2Q06348 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Prrx2Q06348 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Prrx2Q06348 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Prrx2Q06348 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Prrx2Q06348 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Prrx2Q06348 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Prrx2Q06348 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Prrx2Q06348 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Prrx2Q06348 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Prrx2Q06348 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Prrx2Q06348 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Prrx2Q06348 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Prrx2Q06348 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Prrx2Q06348 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Prrx2Q06348 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Prrx2Q06348 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Prrx2Q06348 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Prrx2Q06348 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Prrx2Q06348 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Prrx2Q06348 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Prrx2Q06348 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Prrx2Q06348 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Prrx2Q06348 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Prrx2Q06348 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Prrx2Q06348 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Prrx2Q06348 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Prrx2Q06348 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Prrx2Q06348 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Prrx2Q06348 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Prrx2Q06348 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Prrx2Q06348 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Prrx2Q06348 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Prrx2Q06348 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Prrx2Q06348 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Prrx2Q06348 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Prrx2Q06348 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Prrx2Q06348 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Prrx2Q06348 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Prrx2Q06348 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Prrx2Q06348 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Prrx2Q06348 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Prrx2Q06348 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Prrx2Q06348 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Prrx2Q06348 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Prrx2Q06348 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Prrx2Q06348 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Prrx2Q06348 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Prrx2Q06348 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Prrx2Q06348 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Prrx2Q06348 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Prrx2Q06348 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Prrx2Q06348 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Prrx2Q06348 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Prrx2Q06348 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Prrx2Q06348 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Prrx2Q06348 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Prrx2Q06348 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Prrx2Q06348 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Prrx2Q06348 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Prrx2Q06348 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms