Protein–RNA interactions for Protein: Q05AH6

SPINDOC, SPIN1-docking protein, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPINDOCQ05AH6 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SPINDOCQ05AH6 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SPINDOCQ05AH6 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SPINDOCQ05AH6 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SPINDOCQ05AH6 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SPINDOCQ05AH6 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SPINDOCQ05AH6 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SPINDOCQ05AH6 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SPINDOCQ05AH6 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SPINDOCQ05AH6 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SPINDOCQ05AH6 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SPINDOCQ05AH6 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SPINDOCQ05AH6 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SPINDOCQ05AH6 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SPINDOCQ05AH6 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SPINDOCQ05AH6 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SPINDOCQ05AH6 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SPINDOCQ05AH6 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SPINDOCQ05AH6 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SPINDOCQ05AH6 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SPINDOCQ05AH6 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SPINDOCQ05AH6 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SPINDOCQ05AH6 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SPINDOCQ05AH6 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SPINDOCQ05AH6 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SPINDOCQ05AH6 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SPINDOCQ05AH6 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SPINDOCQ05AH6 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SPINDOCQ05AH6 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SPINDOCQ05AH6 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPINDOCQ05AH6 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPINDOCQ05AH6 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPINDOCQ05AH6 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPINDOCQ05AH6 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPINDOCQ05AH6 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPINDOCQ05AH6 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPINDOCQ05AH6 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPINDOCQ05AH6 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPINDOCQ05AH6 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SPINDOCQ05AH6 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SPINDOCQ05AH6 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPINDOCQ05AH6 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPINDOCQ05AH6 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPINDOCQ05AH6 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPINDOCQ05AH6 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPINDOCQ05AH6 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPINDOCQ05AH6 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPINDOCQ05AH6 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPINDOCQ05AH6 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPINDOCQ05AH6 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPINDOCQ05AH6 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPINDOCQ05AH6 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPINDOCQ05AH6 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPINDOCQ05AH6 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPINDOCQ05AH6 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPINDOCQ05AH6 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPINDOCQ05AH6 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPINDOCQ05AH6 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPINDOCQ05AH6 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPINDOCQ05AH6 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPINDOCQ05AH6 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPINDOCQ05AH6 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPINDOCQ05AH6 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPINDOCQ05AH6 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SPINDOCQ05AH6 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPINDOCQ05AH6 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPINDOCQ05AH6 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPINDOCQ05AH6 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPINDOCQ05AH6 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPINDOCQ05AH6 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPINDOCQ05AH6 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPINDOCQ05AH6 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SPINDOCQ05AH6 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPINDOCQ05AH6 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SPINDOCQ05AH6 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPINDOCQ05AH6 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPINDOCQ05AH6 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPINDOCQ05AH6 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPINDOCQ05AH6 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPINDOCQ05AH6 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPINDOCQ05AH6 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPINDOCQ05AH6 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPINDOCQ05AH6 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPINDOCQ05AH6 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPINDOCQ05AH6 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPINDOCQ05AH6 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPINDOCQ05AH6 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SPINDOCQ05AH6 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPINDOCQ05AH6 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SPINDOCQ05AH6 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPINDOCQ05AH6 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPINDOCQ05AH6 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPINDOCQ05AH6 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPINDOCQ05AH6 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPINDOCQ05AH6 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SPINDOCQ05AH6 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPINDOCQ05AH6 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPINDOCQ05AH6 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPINDOCQ05AH6 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPINDOCQ05AH6 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.8 ms