Protein–RNA interactions for Protein: Q05909

Ptprg, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, mousemouse

Predictions only

Length 1,442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprgQ05909 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PtprgQ05909 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PtprgQ05909 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PtprgQ05909 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PtprgQ05909 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PtprgQ05909 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PtprgQ05909 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PtprgQ05909 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PtprgQ05909 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PtprgQ05909 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PtprgQ05909 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PtprgQ05909 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PtprgQ05909 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PtprgQ05909 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PtprgQ05909 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PtprgQ05909 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PtprgQ05909 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
PtprgQ05909 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PtprgQ05909 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PtprgQ05909 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PtprgQ05909 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PtprgQ05909 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PtprgQ05909 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PtprgQ05909 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PtprgQ05909 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PtprgQ05909 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PtprgQ05909 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PtprgQ05909 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PtprgQ05909 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PtprgQ05909 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
PtprgQ05909 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PtprgQ05909 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PtprgQ05909 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PtprgQ05909 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PtprgQ05909 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PtprgQ05909 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PtprgQ05909 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PtprgQ05909 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PtprgQ05909 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PtprgQ05909 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PtprgQ05909 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PtprgQ05909 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PtprgQ05909 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PtprgQ05909 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PtprgQ05909 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PtprgQ05909 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PtprgQ05909 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PtprgQ05909 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PtprgQ05909 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PtprgQ05909 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
PtprgQ05909 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PtprgQ05909 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PtprgQ05909 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PtprgQ05909 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PtprgQ05909 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PtprgQ05909 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PtprgQ05909 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PtprgQ05909 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PtprgQ05909 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PtprgQ05909 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PtprgQ05909 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PtprgQ05909 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PtprgQ05909 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
PtprgQ05909 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
PtprgQ05909 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PtprgQ05909 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PtprgQ05909 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PtprgQ05909 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PtprgQ05909 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PtprgQ05909 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PtprgQ05909 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PtprgQ05909 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PtprgQ05909 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PtprgQ05909 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PtprgQ05909 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PtprgQ05909 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PtprgQ05909 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PtprgQ05909 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PtprgQ05909 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PtprgQ05909 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PtprgQ05909 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PtprgQ05909 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PtprgQ05909 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PtprgQ05909 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PtprgQ05909 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PtprgQ05909 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PtprgQ05909 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PtprgQ05909 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PtprgQ05909 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PtprgQ05909 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PtprgQ05909 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PtprgQ05909 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PtprgQ05909 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PtprgQ05909 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PtprgQ05909 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PtprgQ05909 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
PtprgQ05909 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
PtprgQ05909 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
PtprgQ05909 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
PtprgQ05909 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.2 ms