Protein–RNA interactions for Protein: Q05895

Thbs3, Thrombospondin-3, mousemouse

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Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs3Q05895 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Thbs3Q05895 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Thbs3Q05895 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Thbs3Q05895 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Thbs3Q05895 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Thbs3Q05895 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Thbs3Q05895 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Thbs3Q05895 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Thbs3Q05895 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Thbs3Q05895 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Thbs3Q05895 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Thbs3Q05895 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Thbs3Q05895 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Thbs3Q05895 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Thbs3Q05895 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Thbs3Q05895 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Thbs3Q05895 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Thbs3Q05895 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Thbs3Q05895 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Thbs3Q05895 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Thbs3Q05895 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Thbs3Q05895 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Thbs3Q05895 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Thbs3Q05895 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Thbs3Q05895 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Thbs3Q05895 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Thbs3Q05895 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Thbs3Q05895 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Thbs3Q05895 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Thbs3Q05895 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Thbs3Q05895 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Thbs3Q05895 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Thbs3Q05895 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Thbs3Q05895 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Thbs3Q05895 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Thbs3Q05895 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Thbs3Q05895 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Thbs3Q05895 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Thbs3Q05895 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Thbs3Q05895 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Thbs3Q05895 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Thbs3Q05895 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Thbs3Q05895 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Thbs3Q05895 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Thbs3Q05895 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Thbs3Q05895 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Thbs3Q05895 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Thbs3Q05895 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Thbs3Q05895 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Thbs3Q05895 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Thbs3Q05895 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Thbs3Q05895 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Thbs3Q05895 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Thbs3Q05895 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Thbs3Q05895 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Thbs3Q05895 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Thbs3Q05895 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Thbs3Q05895 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Thbs3Q05895 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Thbs3Q05895 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Thbs3Q05895 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Thbs3Q05895 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Thbs3Q05895 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Thbs3Q05895 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Thbs3Q05895 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Thbs3Q05895 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Thbs3Q05895 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Thbs3Q05895 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Thbs3Q05895 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Thbs3Q05895 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Thbs3Q05895 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Thbs3Q05895 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Thbs3Q05895 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Thbs3Q05895 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Thbs3Q05895 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Thbs3Q05895 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Thbs3Q05895 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Thbs3Q05895 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Thbs3Q05895 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Thbs3Q05895 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Thbs3Q05895 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Thbs3Q05895 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Thbs3Q05895 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Thbs3Q05895 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Thbs3Q05895 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Thbs3Q05895 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Thbs3Q05895 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Thbs3Q05895 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Thbs3Q05895 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Thbs3Q05895 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Thbs3Q05895 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Thbs3Q05895 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Thbs3Q05895 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Thbs3Q05895 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Thbs3Q05895 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Thbs3Q05895 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Thbs3Q05895 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Thbs3Q05895 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Thbs3Q05895 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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