Protein–RNA interactions for Protein: Q05306

Col10a1, Collagen alpha-1(X) chain, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col10a1Q05306 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col10a1Q05306 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col10a1Q05306 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col10a1Q05306 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Col10a1Q05306 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col10a1Q05306 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col10a1Q05306 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col10a1Q05306 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col10a1Q05306 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col10a1Q05306 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col10a1Q05306 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col10a1Q05306 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col10a1Q05306 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col10a1Q05306 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col10a1Q05306 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col10a1Q05306 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col10a1Q05306 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col10a1Q05306 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col10a1Q05306 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col10a1Q05306 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col10a1Q05306 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col10a1Q05306 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col10a1Q05306 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col10a1Q05306 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col10a1Q05306 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col10a1Q05306 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col10a1Q05306 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col10a1Q05306 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col10a1Q05306 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col10a1Q05306 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col10a1Q05306 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col10a1Q05306 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col10a1Q05306 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Col10a1Q05306 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col10a1Q05306 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col10a1Q05306 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col10a1Q05306 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col10a1Q05306 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col10a1Q05306 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col10a1Q05306 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col10a1Q05306 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col10a1Q05306 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col10a1Q05306 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col10a1Q05306 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col10a1Q05306 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col10a1Q05306 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col10a1Q05306 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col10a1Q05306 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Col10a1Q05306 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Col10a1Q05306 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col10a1Q05306 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Col10a1Q05306 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col10a1Q05306 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col10a1Q05306 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col10a1Q05306 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col10a1Q05306 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col10a1Q05306 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Col10a1Q05306 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col10a1Q05306 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col10a1Q05306 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col10a1Q05306 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col10a1Q05306 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col10a1Q05306 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col10a1Q05306 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col10a1Q05306 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col10a1Q05306 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col10a1Q05306 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col10a1Q05306 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col10a1Q05306 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col10a1Q05306 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col10a1Q05306 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col10a1Q05306 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col10a1Q05306 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col10a1Q05306 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col10a1Q05306 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col10a1Q05306 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col10a1Q05306 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col10a1Q05306 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col10a1Q05306 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col10a1Q05306 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col10a1Q05306 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col10a1Q05306 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col10a1Q05306 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col10a1Q05306 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col10a1Q05306 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col10a1Q05306 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col10a1Q05306 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col10a1Q05306 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col10a1Q05306 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col10a1Q05306 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col10a1Q05306 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Col10a1Q05306 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Col10a1Q05306 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Col10a1Q05306 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Col10a1Q05306 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Col10a1Q05306 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Col10a1Q05306 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Col10a1Q05306 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Col10a1Q05306 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Col10a1Q05306 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms