Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sox12Q04890 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sox12Q04890 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sox12Q04890 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sox12Q04890 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sox12Q04890 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sox12Q04890 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sox12Q04890 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sox12Q04890 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sox12Q04890 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sox12Q04890 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sox12Q04890 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sox12Q04890 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sox12Q04890 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sox12Q04890 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sox12Q04890 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sox12Q04890 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sox12Q04890 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Sox12Q04890 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sox12Q04890 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Sox12Q04890 AC124408.1-201ENSMUST00000228938 707 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Sox12Q04890 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sox12Q04890 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sox12Q04890 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sox12Q04890 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sox12Q04890 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sox12Q04890 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sox12Q04890 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sox12Q04890 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sox12Q04890 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Sox12Q04890 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sox12Q04890 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sox12Q04890 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sox12Q04890 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sox12Q04890 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sox12Q04890 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sox12Q04890 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sox12Q04890 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sox12Q04890 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sox12Q04890 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sox12Q04890 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sox12Q04890 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sox12Q04890 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sox12Q04890 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sox12Q04890 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sox12Q04890 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sox12Q04890 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sox12Q04890 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sox12Q04890 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sox12Q04890 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sox12Q04890 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sox12Q04890 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sox12Q04890 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sox12Q04890 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sox12Q04890 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sox12Q04890 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Sox12Q04890 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Sox12Q04890 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Sox12Q04890 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sox12Q04890 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sox12Q04890 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Sox12Q04890 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Sox12Q04890 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sox12Q04890 AC159246.1-201ENSMUST00000214478 249 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Sox12Q04890 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sox12Q04890 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Sox12Q04890 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sox12Q04890 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sox12Q04890 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sox12Q04890 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sox12Q04890 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sox12Q04890 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Sox12Q04890 Gm13366-201ENSMUST00000122198 970 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Sox12Q04890 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sox12Q04890 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sox12Q04890 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sox12Q04890 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sox12Q04890 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sox12Q04890 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sox12Q04890 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sox12Q04890 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sox12Q04890 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sox12Q04890 Ifna2-201ENSMUST00000105147 1032 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sox12Q04890 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Sox12Q04890 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Sox12Q04890 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sox12Q04890 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sox12Q04890 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Sox12Q04890 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Sox12Q04890 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Sox12Q04890 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Sox12Q04890 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Sox12Q04890 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Sox12Q04890 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Sox12Q04890 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Sox12Q04890 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Sox12Q04890 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Sox12Q04890 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Sox12Q04890 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Sox12Q04890 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.7 ms