Protein–RNA interactions for Protein: Q04742

Emx1, Homeobox protein EMX1, mousemouse

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Emx1Q04742 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Emx1Q04742 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Emx1Q04742 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Emx1Q04742 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Emx1Q04742 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Emx1Q04742 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Emx1Q04742 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Emx1Q04742 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Emx1Q04742 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Emx1Q04742 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Emx1Q04742 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Emx1Q04742 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Emx1Q04742 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Emx1Q04742 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Emx1Q04742 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Emx1Q04742 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Emx1Q04742 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Emx1Q04742 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Emx1Q04742 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Emx1Q04742 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Emx1Q04742 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Emx1Q04742 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Emx1Q04742 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Emx1Q04742 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Emx1Q04742 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Emx1Q04742 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Emx1Q04742 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Emx1Q04742 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Emx1Q04742 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Emx1Q04742 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Emx1Q04742 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Emx1Q04742 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Emx1Q04742 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Emx1Q04742 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Emx1Q04742 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Emx1Q04742 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Emx1Q04742 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Emx1Q04742 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Emx1Q04742 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Emx1Q04742 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Emx1Q04742 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Emx1Q04742 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Emx1Q04742 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Emx1Q04742 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Emx1Q04742 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Emx1Q04742 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Emx1Q04742 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Emx1Q04742 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Emx1Q04742 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Emx1Q04742 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Emx1Q04742 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Emx1Q04742 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Emx1Q04742 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Emx1Q04742 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Emx1Q04742 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Emx1Q04742 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Emx1Q04742 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Emx1Q04742 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Emx1Q04742 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Emx1Q04742 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Emx1Q04742 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Emx1Q04742 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Emx1Q04742 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Emx1Q04742 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Emx1Q04742 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Emx1Q04742 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Emx1Q04742 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Emx1Q04742 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Emx1Q04742 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Emx1Q04742 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Emx1Q04742 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Emx1Q04742 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Emx1Q04742 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Emx1Q04742 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Emx1Q04742 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Emx1Q04742 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Emx1Q04742 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Emx1Q04742 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Emx1Q04742 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Emx1Q04742 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Emx1Q04742 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Emx1Q04742 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Emx1Q04742 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Emx1Q04742 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Emx1Q04742 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Emx1Q04742 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Emx1Q04742 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Emx1Q04742 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Emx1Q04742 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Emx1Q04742 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Emx1Q04742 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Emx1Q04742 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Emx1Q04742 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Emx1Q04742 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Emx1Q04742 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Emx1Q04742 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Emx1Q04742 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Emx1Q04742 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Emx1Q04742 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Emx1Q04742 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms