Protein–RNA interactions for Protein: Q04692

Smarcad1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A containing DEAD/H box 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,021 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcad1Q04692 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smarcad1Q04692 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Smarcad1Q04692 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smarcad1Q04692 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smarcad1Q04692 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smarcad1Q04692 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smarcad1Q04692 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Smarcad1Q04692 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smarcad1Q04692 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smarcad1Q04692 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smarcad1Q04692 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smarcad1Q04692 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smarcad1Q04692 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smarcad1Q04692 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smarcad1Q04692 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smarcad1Q04692 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smarcad1Q04692 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smarcad1Q04692 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smarcad1Q04692 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smarcad1Q04692 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smarcad1Q04692 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smarcad1Q04692 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smarcad1Q04692 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smarcad1Q04692 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smarcad1Q04692 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smarcad1Q04692 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smarcad1Q04692 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smarcad1Q04692 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smarcad1Q04692 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smarcad1Q04692 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smarcad1Q04692 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smarcad1Q04692 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smarcad1Q04692 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smarcad1Q04692 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smarcad1Q04692 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Smarcad1Q04692 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smarcad1Q04692 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smarcad1Q04692 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smarcad1Q04692 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smarcad1Q04692 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smarcad1Q04692 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smarcad1Q04692 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smarcad1Q04692 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smarcad1Q04692 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smarcad1Q04692 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smarcad1Q04692 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smarcad1Q04692 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smarcad1Q04692 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smarcad1Q04692 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smarcad1Q04692 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smarcad1Q04692 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smarcad1Q04692 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smarcad1Q04692 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smarcad1Q04692 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smarcad1Q04692 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smarcad1Q04692 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smarcad1Q04692 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Smarcad1Q04692 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smarcad1Q04692 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smarcad1Q04692 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smarcad1Q04692 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smarcad1Q04692 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smarcad1Q04692 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Smarcad1Q04692 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smarcad1Q04692 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smarcad1Q04692 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smarcad1Q04692 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smarcad1Q04692 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smarcad1Q04692 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smarcad1Q04692 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smarcad1Q04692 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smarcad1Q04692 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smarcad1Q04692 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smarcad1Q04692 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Smarcad1Q04692 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smarcad1Q04692 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Smarcad1Q04692 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smarcad1Q04692 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smarcad1Q04692 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smarcad1Q04692 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smarcad1Q04692 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smarcad1Q04692 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smarcad1Q04692 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smarcad1Q04692 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smarcad1Q04692 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smarcad1Q04692 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smarcad1Q04692 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smarcad1Q04692 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smarcad1Q04692 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smarcad1Q04692 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Smarcad1Q04692 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Smarcad1Q04692 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smarcad1Q04692 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Smarcad1Q04692 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Smarcad1Q04692 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smarcad1Q04692 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smarcad1Q04692 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smarcad1Q04692 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smarcad1Q04692 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Smarcad1Q04692 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms