Protein–RNA interactions for Protein: Q03717

Kcnb1, Potassium voltage-gated channel subfamily B member 1, mousemouse

Predictions only

Length 857 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnb1Q03717 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Kcnb1Q03717 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Kcnb1Q03717 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Kcnb1Q03717 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Kcnb1Q03717 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Kcnb1Q03717 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Kcnb1Q03717 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Kcnb1Q03717 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Kcnb1Q03717 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Kcnb1Q03717 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Kcnb1Q03717 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Kcnb1Q03717 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Kcnb1Q03717 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Kcnb1Q03717 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Kcnb1Q03717 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Kcnb1Q03717 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Kcnb1Q03717 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Kcnb1Q03717 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Kcnb1Q03717 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Kcnb1Q03717 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Kcnb1Q03717 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Kcnb1Q03717 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Kcnb1Q03717 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Kcnb1Q03717 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Kcnb1Q03717 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Kcnb1Q03717 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Kcnb1Q03717 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Kcnb1Q03717 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Kcnb1Q03717 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Kcnb1Q03717 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Kcnb1Q03717 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Kcnb1Q03717 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Kcnb1Q03717 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Kcnb1Q03717 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Kcnb1Q03717 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Kcnb1Q03717 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Kcnb1Q03717 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Kcnb1Q03717 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Kcnb1Q03717 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Kcnb1Q03717 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Kcnb1Q03717 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Kcnb1Q03717 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Kcnb1Q03717 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Kcnb1Q03717 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Kcnb1Q03717 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Kcnb1Q03717 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Kcnb1Q03717 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Kcnb1Q03717 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Kcnb1Q03717 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Kcnb1Q03717 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Kcnb1Q03717 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Kcnb1Q03717 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Kcnb1Q03717 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Kcnb1Q03717 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Kcnb1Q03717 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Kcnb1Q03717 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Kcnb1Q03717 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Kcnb1Q03717 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Kcnb1Q03717 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Kcnb1Q03717 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Kcnb1Q03717 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Kcnb1Q03717 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Kcnb1Q03717 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Kcnb1Q03717 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Kcnb1Q03717 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Kcnb1Q03717 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Kcnb1Q03717 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Kcnb1Q03717 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Kcnb1Q03717 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Kcnb1Q03717 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Kcnb1Q03717 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Kcnb1Q03717 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Kcnb1Q03717 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Kcnb1Q03717 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Kcnb1Q03717 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Kcnb1Q03717 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Kcnb1Q03717 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Kcnb1Q03717 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Kcnb1Q03717 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Kcnb1Q03717 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Kcnb1Q03717 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Kcnb1Q03717 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Kcnb1Q03717 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Kcnb1Q03717 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Kcnb1Q03717 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Kcnb1Q03717 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Kcnb1Q03717 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Kcnb1Q03717 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Kcnb1Q03717 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Kcnb1Q03717 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Kcnb1Q03717 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Kcnb1Q03717 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Kcnb1Q03717 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Kcnb1Q03717 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Kcnb1Q03717 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Kcnb1Q03717 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Kcnb1Q03717 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Kcnb1Q03717 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Kcnb1Q03717 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Kcnb1Q03717 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms