Protein–RNA interactions for Protein: Q03146

Ddr1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddr1Q03146 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ddr1Q03146 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Ddr1Q03146 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Ddr1Q03146 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ddr1Q03146 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ddr1Q03146 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ddr1Q03146 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ddr1Q03146 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ddr1Q03146 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ddr1Q03146 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ddr1Q03146 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ddr1Q03146 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ddr1Q03146 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ddr1Q03146 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ddr1Q03146 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ddr1Q03146 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ddr1Q03146 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ddr1Q03146 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ddr1Q03146 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ddr1Q03146 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ddr1Q03146 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ddr1Q03146 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ddr1Q03146 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ddr1Q03146 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ddr1Q03146 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ddr1Q03146 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ddr1Q03146 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ddr1Q03146 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ddr1Q03146 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ddr1Q03146 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ddr1Q03146 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ddr1Q03146 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ddr1Q03146 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ddr1Q03146 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ddr1Q03146 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ddr1Q03146 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ddr1Q03146 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ddr1Q03146 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ddr1Q03146 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ddr1Q03146 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ddr1Q03146 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ddr1Q03146 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ddr1Q03146 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ddr1Q03146 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Ddr1Q03146 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ddr1Q03146 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ddr1Q03146 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ddr1Q03146 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ddr1Q03146 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Ddr1Q03146 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Ddr1Q03146 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ddr1Q03146 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Ddr1Q03146 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ddr1Q03146 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ddr1Q03146 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ddr1Q03146 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ddr1Q03146 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ddr1Q03146 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ddr1Q03146 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ddr1Q03146 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ddr1Q03146 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ddr1Q03146 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ddr1Q03146 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ddr1Q03146 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ddr1Q03146 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ddr1Q03146 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ddr1Q03146 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ddr1Q03146 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ddr1Q03146 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ddr1Q03146 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ddr1Q03146 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Ddr1Q03146 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ddr1Q03146 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ddr1Q03146 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ddr1Q03146 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ddr1Q03146 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ddr1Q03146 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ddr1Q03146 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ddr1Q03146 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ddr1Q03146 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ddr1Q03146 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ddr1Q03146 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ddr1Q03146 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ddr1Q03146 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Ddr1Q03146 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ddr1Q03146 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ddr1Q03146 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ddr1Q03146 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ddr1Q03146 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ddr1Q03146 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ddr1Q03146 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Ddr1Q03146 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Ddr1Q03146 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Ddr1Q03146 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ddr1Q03146 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ddr1Q03146 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ddr1Q03146 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ddr1Q03146 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ddr1Q03146 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ddr1Q03146 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms