Protein–RNA interactions for Protein: Q02853

Mmp11, Stromelysin-3, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp11Q02853 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mmp11Q02853 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mmp11Q02853 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mmp11Q02853 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mmp11Q02853 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Mmp11Q02853 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mmp11Q02853 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Mmp11Q02853 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mmp11Q02853 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mmp11Q02853 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mmp11Q02853 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mmp11Q02853 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mmp11Q02853 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mmp11Q02853 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mmp11Q02853 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mmp11Q02853 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mmp11Q02853 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mmp11Q02853 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mmp11Q02853 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mmp11Q02853 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Mmp11Q02853 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mmp11Q02853 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mmp11Q02853 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mmp11Q02853 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mmp11Q02853 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mmp11Q02853 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mmp11Q02853 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mmp11Q02853 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mmp11Q02853 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Mmp11Q02853 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mmp11Q02853 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mmp11Q02853 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mmp11Q02853 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mmp11Q02853 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mmp11Q02853 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mmp11Q02853 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mmp11Q02853 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mmp11Q02853 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mmp11Q02853 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mmp11Q02853 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mmp11Q02853 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Mmp11Q02853 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mmp11Q02853 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Mmp11Q02853 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mmp11Q02853 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mmp11Q02853 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mmp11Q02853 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mmp11Q02853 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mmp11Q02853 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Mmp11Q02853 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mmp11Q02853 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mmp11Q02853 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mmp11Q02853 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mmp11Q02853 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mmp11Q02853 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mmp11Q02853 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mmp11Q02853 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mmp11Q02853 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mmp11Q02853 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mmp11Q02853 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mmp11Q02853 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mmp11Q02853 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mmp11Q02853 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mmp11Q02853 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mmp11Q02853 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mmp11Q02853 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mmp11Q02853 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mmp11Q02853 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Mmp11Q02853 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mmp11Q02853 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mmp11Q02853 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mmp11Q02853 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mmp11Q02853 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mmp11Q02853 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mmp11Q02853 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mmp11Q02853 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mmp11Q02853 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mmp11Q02853 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mmp11Q02853 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Mmp11Q02853 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mmp11Q02853 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mmp11Q02853 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mmp11Q02853 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mmp11Q02853 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mmp11Q02853 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mmp11Q02853 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mmp11Q02853 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mmp11Q02853 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mmp11Q02853 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mmp11Q02853 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mmp11Q02853 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mmp11Q02853 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mmp11Q02853 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mmp11Q02853 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mmp11Q02853 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mmp11Q02853 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mmp11Q02853 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mmp11Q02853 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mmp11Q02853 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mmp11Q02853 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms