Protein–RNA interactions for Protein: Q02788

Col6a2, Collagen alpha-2(VI) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,034 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col6a2Q02788 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Col6a2Q02788 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Col6a2Q02788 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Col6a2Q02788 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Col6a2Q02788 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Col6a2Q02788 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Col6a2Q02788 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Col6a2Q02788 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Col6a2Q02788 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Col6a2Q02788 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Col6a2Q02788 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Col6a2Q02788 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Col6a2Q02788 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Col6a2Q02788 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Col6a2Q02788 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Col6a2Q02788 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Col6a2Q02788 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Col6a2Q02788 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Col6a2Q02788 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Col6a2Q02788 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Col6a2Q02788 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Col6a2Q02788 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Col6a2Q02788 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Col6a2Q02788 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Col6a2Q02788 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Col6a2Q02788 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Col6a2Q02788 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Col6a2Q02788 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Col6a2Q02788 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Col6a2Q02788 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Col6a2Q02788 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Col6a2Q02788 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Col6a2Q02788 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Col6a2Q02788 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Col6a2Q02788 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Col6a2Q02788 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Col6a2Q02788 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Col6a2Q02788 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Col6a2Q02788 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Col6a2Q02788 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Col6a2Q02788 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Col6a2Q02788 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Col6a2Q02788 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Col6a2Q02788 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Col6a2Q02788 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Col6a2Q02788 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Col6a2Q02788 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Col6a2Q02788 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Col6a2Q02788 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Col6a2Q02788 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Col6a2Q02788 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Col6a2Q02788 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Col6a2Q02788 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Col6a2Q02788 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Col6a2Q02788 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Col6a2Q02788 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Col6a2Q02788 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Col6a2Q02788 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Col6a2Q02788 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Col6a2Q02788 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Col6a2Q02788 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Col6a2Q02788 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Col6a2Q02788 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Col6a2Q02788 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Col6a2Q02788 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Col6a2Q02788 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Col6a2Q02788 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Col6a2Q02788 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Col6a2Q02788 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Col6a2Q02788 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Col6a2Q02788 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Col6a2Q02788 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Col6a2Q02788 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Col6a2Q02788 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Col6a2Q02788 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Col6a2Q02788 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Col6a2Q02788 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Col6a2Q02788 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Col6a2Q02788 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Col6a2Q02788 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Col6a2Q02788 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Col6a2Q02788 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Col6a2Q02788 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Col6a2Q02788 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Col6a2Q02788 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Col6a2Q02788 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Col6a2Q02788 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Col6a2Q02788 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Col6a2Q02788 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Col6a2Q02788 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Col6a2Q02788 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Col6a2Q02788 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Col6a2Q02788 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Col6a2Q02788 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Col6a2Q02788 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Col6a2Q02788 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Col6a2Q02788 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Col6a2Q02788 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Col6a2Q02788 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Col6a2Q02788 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms