Protein–RNA interactions for Protein: Q02739

Gjb5, Gap junction beta-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb5Q02739 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gjb5Q02739 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gjb5Q02739 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gjb5Q02739 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gjb5Q02739 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gjb5Q02739 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gjb5Q02739 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gjb5Q02739 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gjb5Q02739 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gjb5Q02739 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gjb5Q02739 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gjb5Q02739 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gjb5Q02739 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gjb5Q02739 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gjb5Q02739 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gjb5Q02739 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gjb5Q02739 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gjb5Q02739 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gjb5Q02739 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gjb5Q02739 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gjb5Q02739 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gjb5Q02739 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gjb5Q02739 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gjb5Q02739 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gjb5Q02739 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gjb5Q02739 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gjb5Q02739 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gjb5Q02739 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gjb5Q02739 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gjb5Q02739 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gjb5Q02739 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gjb5Q02739 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gjb5Q02739 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gjb5Q02739 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gjb5Q02739 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gjb5Q02739 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gjb5Q02739 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Gjb5Q02739 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gjb5Q02739 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Gjb5Q02739 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Gjb5Q02739 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gjb5Q02739 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gjb5Q02739 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gjb5Q02739 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gjb5Q02739 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gjb5Q02739 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gjb5Q02739 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gjb5Q02739 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gjb5Q02739 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gjb5Q02739 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gjb5Q02739 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gjb5Q02739 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gjb5Q02739 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gjb5Q02739 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Gjb5Q02739 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gjb5Q02739 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gjb5Q02739 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gjb5Q02739 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gjb5Q02739 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gjb5Q02739 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gjb5Q02739 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gjb5Q02739 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gjb5Q02739 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gjb5Q02739 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gjb5Q02739 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gjb5Q02739 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gjb5Q02739 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gjb5Q02739 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gjb5Q02739 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Gjb5Q02739 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gjb5Q02739 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gjb5Q02739 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gjb5Q02739 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gjb5Q02739 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gjb5Q02739 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gjb5Q02739 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gjb5Q02739 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gjb5Q02739 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gjb5Q02739 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gjb5Q02739 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gjb5Q02739 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gjb5Q02739 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Gjb5Q02739 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gjb5Q02739 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gjb5Q02739 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gjb5Q02739 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gjb5Q02739 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gjb5Q02739 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gjb5Q02739 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gjb5Q02739 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gjb5Q02739 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gjb5Q02739 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gjb5Q02739 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gjb5Q02739 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gjb5Q02739 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gjb5Q02739 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gjb5Q02739 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gjb5Q02739 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gjb5Q02739 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gjb5Q02739 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms