Protein–RNA interactions for Protein: Q02591

Gsc, Homeobox protein goosecoid, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GscQ02591 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GscQ02591 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GscQ02591 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GscQ02591 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GscQ02591 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GscQ02591 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GscQ02591 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GscQ02591 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GscQ02591 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GscQ02591 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
GscQ02591 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GscQ02591 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GscQ02591 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GscQ02591 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GscQ02591 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GscQ02591 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GscQ02591 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GscQ02591 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GscQ02591 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GscQ02591 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GscQ02591 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GscQ02591 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GscQ02591 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GscQ02591 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GscQ02591 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GscQ02591 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
GscQ02591 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GscQ02591 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GscQ02591 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GscQ02591 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GscQ02591 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GscQ02591 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GscQ02591 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GscQ02591 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GscQ02591 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GscQ02591 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GscQ02591 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
GscQ02591 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GscQ02591 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GscQ02591 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GscQ02591 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GscQ02591 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GscQ02591 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GscQ02591 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GscQ02591 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GscQ02591 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
GscQ02591 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GscQ02591 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GscQ02591 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
GscQ02591 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GscQ02591 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GscQ02591 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GscQ02591 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GscQ02591 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
GscQ02591 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GscQ02591 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GscQ02591 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GscQ02591 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GscQ02591 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GscQ02591 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GscQ02591 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GscQ02591 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GscQ02591 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GscQ02591 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GscQ02591 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GscQ02591 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GscQ02591 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GscQ02591 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GscQ02591 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GscQ02591 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GscQ02591 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GscQ02591 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GscQ02591 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
GscQ02591 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
GscQ02591 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GscQ02591 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GscQ02591 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GscQ02591 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GscQ02591 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GscQ02591 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GscQ02591 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
GscQ02591 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
GscQ02591 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
GscQ02591 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GscQ02591 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GscQ02591 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GscQ02591 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GscQ02591 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GscQ02591 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GscQ02591 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GscQ02591 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GscQ02591 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GscQ02591 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GscQ02591 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GscQ02591 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GscQ02591 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GscQ02591 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GscQ02591 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GscQ02591 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
GscQ02591 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms