Protein–RNA interactions for Protein: Q02576

Nhlh1, Helix-loop-helix protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlh1Q02576 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nhlh1Q02576 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nhlh1Q02576 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nhlh1Q02576 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nhlh1Q02576 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nhlh1Q02576 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Nhlh1Q02576 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nhlh1Q02576 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nhlh1Q02576 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nhlh1Q02576 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nhlh1Q02576 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nhlh1Q02576 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nhlh1Q02576 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nhlh1Q02576 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nhlh1Q02576 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nhlh1Q02576 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nhlh1Q02576 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nhlh1Q02576 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nhlh1Q02576 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Nhlh1Q02576 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nhlh1Q02576 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nhlh1Q02576 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nhlh1Q02576 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nhlh1Q02576 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nhlh1Q02576 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nhlh1Q02576 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nhlh1Q02576 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nhlh1Q02576 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nhlh1Q02576 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nhlh1Q02576 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nhlh1Q02576 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nhlh1Q02576 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nhlh1Q02576 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Nhlh1Q02576 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nhlh1Q02576 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nhlh1Q02576 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nhlh1Q02576 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nhlh1Q02576 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nhlh1Q02576 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nhlh1Q02576 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nhlh1Q02576 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nhlh1Q02576 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nhlh1Q02576 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nhlh1Q02576 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nhlh1Q02576 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nhlh1Q02576 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nhlh1Q02576 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nhlh1Q02576 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Nhlh1Q02576 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nhlh1Q02576 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nhlh1Q02576 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nhlh1Q02576 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Nhlh1Q02576 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nhlh1Q02576 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nhlh1Q02576 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nhlh1Q02576 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nhlh1Q02576 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nhlh1Q02576 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nhlh1Q02576 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nhlh1Q02576 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nhlh1Q02576 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nhlh1Q02576 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nhlh1Q02576 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nhlh1Q02576 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nhlh1Q02576 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nhlh1Q02576 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Nhlh1Q02576 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Nhlh1Q02576 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nhlh1Q02576 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nhlh1Q02576 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nhlh1Q02576 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nhlh1Q02576 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nhlh1Q02576 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nhlh1Q02576 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nhlh1Q02576 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nhlh1Q02576 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nhlh1Q02576 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nhlh1Q02576 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nhlh1Q02576 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nhlh1Q02576 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nhlh1Q02576 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nhlh1Q02576 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nhlh1Q02576 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nhlh1Q02576 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nhlh1Q02576 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Nhlh1Q02576 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nhlh1Q02576 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nhlh1Q02576 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nhlh1Q02576 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nhlh1Q02576 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nhlh1Q02576 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Nhlh1Q02576 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nhlh1Q02576 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nhlh1Q02576 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nhlh1Q02576 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nhlh1Q02576 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nhlh1Q02576 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nhlh1Q02576 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nhlh1Q02576 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nhlh1Q02576 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms