Protein–RNA interactions for Protein: Q02525

Zfp39, Zinc finger protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp39Q02525 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zfp39Q02525 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zfp39Q02525 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Zfp39Q02525 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zfp39Q02525 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zfp39Q02525 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zfp39Q02525 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zfp39Q02525 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zfp39Q02525 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zfp39Q02525 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zfp39Q02525 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zfp39Q02525 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zfp39Q02525 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zfp39Q02525 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zfp39Q02525 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zfp39Q02525 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zfp39Q02525 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zfp39Q02525 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zfp39Q02525 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zfp39Q02525 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zfp39Q02525 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zfp39Q02525 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zfp39Q02525 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zfp39Q02525 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zfp39Q02525 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zfp39Q02525 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zfp39Q02525 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zfp39Q02525 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zfp39Q02525 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zfp39Q02525 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zfp39Q02525 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zfp39Q02525 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zfp39Q02525 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zfp39Q02525 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zfp39Q02525 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zfp39Q02525 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zfp39Q02525 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zfp39Q02525 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zfp39Q02525 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zfp39Q02525 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zfp39Q02525 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zfp39Q02525 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zfp39Q02525 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zfp39Q02525 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zfp39Q02525 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zfp39Q02525 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zfp39Q02525 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zfp39Q02525 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Zfp39Q02525 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Zfp39Q02525 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Zfp39Q02525 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Zfp39Q02525 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Zfp39Q02525 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Zfp39Q02525 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Zfp39Q02525 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zfp39Q02525 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Zfp39Q02525 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zfp39Q02525 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Zfp39Q02525 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zfp39Q02525 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zfp39Q02525 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zfp39Q02525 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zfp39Q02525 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zfp39Q02525 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zfp39Q02525 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zfp39Q02525 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Zfp39Q02525 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfp39Q02525 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfp39Q02525 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfp39Q02525 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfp39Q02525 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfp39Q02525 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfp39Q02525 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfp39Q02525 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfp39Q02525 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfp39Q02525 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfp39Q02525 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfp39Q02525 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfp39Q02525 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfp39Q02525 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfp39Q02525 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfp39Q02525 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfp39Q02525 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfp39Q02525 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfp39Q02525 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfp39Q02525 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfp39Q02525 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfp39Q02525 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfp39Q02525 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfp39Q02525 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfp39Q02525 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfp39Q02525 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfp39Q02525 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zfp39Q02525 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zfp39Q02525 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zfp39Q02525 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zfp39Q02525 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zfp39Q02525 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zfp39Q02525 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zfp39Q02525 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms