Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxd1Q01822 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxd1Q01822 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxd1Q01822 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxd1Q01822 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxd1Q01822 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxd1Q01822 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxd1Q01822 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxd1Q01822 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxd1Q01822 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxd1Q01822 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxd1Q01822 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxd1Q01822 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxd1Q01822 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxd1Q01822 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxd1Q01822 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxd1Q01822 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxd1Q01822 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxd1Q01822 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxd1Q01822 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxd1Q01822 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxd1Q01822 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxd1Q01822 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxd1Q01822 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxd1Q01822 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxd1Q01822 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxd1Q01822 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxd1Q01822 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxd1Q01822 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxd1Q01822 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxd1Q01822 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxd1Q01822 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxd1Q01822 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxd1Q01822 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxd1Q01822 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxd1Q01822 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxd1Q01822 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxd1Q01822 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxd1Q01822 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxd1Q01822 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxd1Q01822 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxd1Q01822 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxd1Q01822 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxd1Q01822 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxd1Q01822 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxd1Q01822 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxd1Q01822 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxd1Q01822 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxd1Q01822 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxd1Q01822 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxd1Q01822 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxd1Q01822 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxd1Q01822 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxd1Q01822 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxd1Q01822 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxd1Q01822 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxd1Q01822 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxd1Q01822 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxd1Q01822 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxd1Q01822 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxd1Q01822 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxd1Q01822 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxd1Q01822 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxd1Q01822 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxd1Q01822 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxd1Q01822 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxd1Q01822 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxd1Q01822 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxd1Q01822 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxd1Q01822 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxd1Q01822 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxd1Q01822 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxd1Q01822 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxd1Q01822 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxd1Q01822 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxd1Q01822 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxd1Q01822 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxd1Q01822 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxd1Q01822 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxd1Q01822 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxd1Q01822 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxd1Q01822 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxd1Q01822 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxd1Q01822 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxd1Q01822 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxd1Q01822 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxd1Q01822 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxd1Q01822 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxd1Q01822 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxd1Q01822 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxd1Q01822 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxd1Q01822 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxd1Q01822 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxd1Q01822 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxd1Q01822 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxd1Q01822 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxd1Q01822 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxd1Q01822 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxd1Q01822 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxd1Q01822 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms