Protein–RNA interactions for Protein: Q01514

Gbp1, Guanylate-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp1Q01514 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gbp1Q01514 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gbp1Q01514 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gbp1Q01514 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gbp1Q01514 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gbp1Q01514 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gbp1Q01514 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gbp1Q01514 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gbp1Q01514 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gbp1Q01514 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gbp1Q01514 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gbp1Q01514 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gbp1Q01514 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gbp1Q01514 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gbp1Q01514 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gbp1Q01514 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gbp1Q01514 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gbp1Q01514 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gbp1Q01514 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gbp1Q01514 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gbp1Q01514 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gbp1Q01514 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gbp1Q01514 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Gbp1Q01514 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gbp1Q01514 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gbp1Q01514 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Gbp1Q01514 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gbp1Q01514 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gbp1Q01514 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Gbp1Q01514 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Gbp1Q01514 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gbp1Q01514 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gbp1Q01514 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gbp1Q01514 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gbp1Q01514 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gbp1Q01514 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gbp1Q01514 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gbp1Q01514 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gbp1Q01514 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gbp1Q01514 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gbp1Q01514 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Gbp1Q01514 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gbp1Q01514 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gbp1Q01514 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gbp1Q01514 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gbp1Q01514 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gbp1Q01514 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gbp1Q01514 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gbp1Q01514 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gbp1Q01514 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gbp1Q01514 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gbp1Q01514 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gbp1Q01514 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gbp1Q01514 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gbp1Q01514 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gbp1Q01514 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gbp1Q01514 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Gbp1Q01514 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gbp1Q01514 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gbp1Q01514 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gbp1Q01514 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gbp1Q01514 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gbp1Q01514 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gbp1Q01514 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gbp1Q01514 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gbp1Q01514 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gbp1Q01514 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gbp1Q01514 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Gbp1Q01514 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gbp1Q01514 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gbp1Q01514 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gbp1Q01514 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gbp1Q01514 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gbp1Q01514 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gbp1Q01514 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gbp1Q01514 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gbp1Q01514 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gbp1Q01514 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gbp1Q01514 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gbp1Q01514 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gbp1Q01514 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gbp1Q01514 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gbp1Q01514 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gbp1Q01514 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gbp1Q01514 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gbp1Q01514 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gbp1Q01514 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gbp1Q01514 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gbp1Q01514 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gbp1Q01514 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gbp1Q01514 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gbp1Q01514 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gbp1Q01514 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gbp1Q01514 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gbp1Q01514 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gbp1Q01514 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gbp1Q01514 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gbp1Q01514 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Gbp1Q01514 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gbp1Q01514 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms