Protein–RNA interactions for Protein: Q01320

Top2a, DNA topoisomerase 2-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2aQ01320 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Top2aQ01320 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Top2aQ01320 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Top2aQ01320 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Top2aQ01320 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Top2aQ01320 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Top2aQ01320 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Top2aQ01320 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Top2aQ01320 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Top2aQ01320 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Top2aQ01320 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Top2aQ01320 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Top2aQ01320 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Top2aQ01320 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Top2aQ01320 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Top2aQ01320 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Top2aQ01320 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Top2aQ01320 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Top2aQ01320 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Top2aQ01320 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Top2aQ01320 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Top2aQ01320 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Top2aQ01320 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Top2aQ01320 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Top2aQ01320 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Top2aQ01320 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Top2aQ01320 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Top2aQ01320 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Top2aQ01320 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Top2aQ01320 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Top2aQ01320 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Top2aQ01320 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Top2aQ01320 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Top2aQ01320 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Top2aQ01320 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Top2aQ01320 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Top2aQ01320 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Top2aQ01320 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Top2aQ01320 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Top2aQ01320 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Top2aQ01320 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Top2aQ01320 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Top2aQ01320 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Top2aQ01320 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Top2aQ01320 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Top2aQ01320 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Top2aQ01320 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Top2aQ01320 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Top2aQ01320 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Top2aQ01320 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Top2aQ01320 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Top2aQ01320 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Top2aQ01320 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Top2aQ01320 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Top2aQ01320 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Top2aQ01320 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Top2aQ01320 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Top2aQ01320 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Top2aQ01320 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Top2aQ01320 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Top2aQ01320 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Top2aQ01320 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Top2aQ01320 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Top2aQ01320 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Top2aQ01320 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Top2aQ01320 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Top2aQ01320 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Top2aQ01320 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Top2aQ01320 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Top2aQ01320 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Top2aQ01320 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Top2aQ01320 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Top2aQ01320 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Top2aQ01320 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Top2aQ01320 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Top2aQ01320 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
Top2aQ01320 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
Top2aQ01320 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Top2aQ01320 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Top2aQ01320 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Top2aQ01320 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Top2aQ01320 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Top2aQ01320 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Top2aQ01320 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Top2aQ01320 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Top2aQ01320 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Top2aQ01320 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Top2aQ01320 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Top2aQ01320 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Top2aQ01320 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Top2aQ01320 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Top2aQ01320 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Top2aQ01320 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Top2aQ01320 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Top2aQ01320 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Top2aQ01320 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Top2aQ01320 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Top2aQ01320 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Top2aQ01320 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Top2aQ01320 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms