Protein–RNA interactions for Protein: Q01098

Grin2c, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2C, mousemouse

Predictions only

Length 1,239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2cQ01098 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Grin2cQ01098 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Grin2cQ01098 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Grin2cQ01098 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Grin2cQ01098 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Grin2cQ01098 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Grin2cQ01098 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Grin2cQ01098 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Grin2cQ01098 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Grin2cQ01098 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Grin2cQ01098 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Grin2cQ01098 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Grin2cQ01098 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Grin2cQ01098 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Grin2cQ01098 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Grin2cQ01098 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Grin2cQ01098 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Grin2cQ01098 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Grin2cQ01098 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Grin2cQ01098 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Grin2cQ01098 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Grin2cQ01098 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Grin2cQ01098 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Grin2cQ01098 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Grin2cQ01098 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Grin2cQ01098 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Grin2cQ01098 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Grin2cQ01098 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Grin2cQ01098 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Grin2cQ01098 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Grin2cQ01098 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Grin2cQ01098 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Grin2cQ01098 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Grin2cQ01098 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Grin2cQ01098 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Grin2cQ01098 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Grin2cQ01098 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Grin2cQ01098 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Grin2cQ01098 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Grin2cQ01098 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Grin2cQ01098 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Grin2cQ01098 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Grin2cQ01098 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Grin2cQ01098 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Grin2cQ01098 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Grin2cQ01098 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Grin2cQ01098 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Grin2cQ01098 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Grin2cQ01098 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Grin2cQ01098 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Grin2cQ01098 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Grin2cQ01098 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Grin2cQ01098 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Grin2cQ01098 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Grin2cQ01098 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Grin2cQ01098 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Grin2cQ01098 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Grin2cQ01098 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Grin2cQ01098 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Grin2cQ01098 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Grin2cQ01098 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Grin2cQ01098 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Grin2cQ01098 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Grin2cQ01098 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Grin2cQ01098 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Grin2cQ01098 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Grin2cQ01098 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Grin2cQ01098 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Grin2cQ01098 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Grin2cQ01098 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Grin2cQ01098 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Grin2cQ01098 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Grin2cQ01098 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Grin2cQ01098 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Grin2cQ01098 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Grin2cQ01098 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Grin2cQ01098 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Grin2cQ01098 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Grin2cQ01098 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Grin2cQ01098 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Grin2cQ01098 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Grin2cQ01098 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Grin2cQ01098 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Grin2cQ01098 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Grin2cQ01098 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Grin2cQ01098 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Grin2cQ01098 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Grin2cQ01098 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Grin2cQ01098 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Grin2cQ01098 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Grin2cQ01098 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Grin2cQ01098 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Grin2cQ01098 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Grin2cQ01098 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Grin2cQ01098 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Grin2cQ01098 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Grin2cQ01098 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Grin2cQ01098 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Grin2cQ01098 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Grin2cQ01098 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms